SFTPA1

SFTPA1 (англ. Surfactant protein A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 248 амінокислот, а молекулярна маса — 26 242.

SFTPA1
Ідентифікатори
Символи	SFTPA1, COLEC4, PSAP, PSP-A, PSPA, SFTP1, SFTPA1B, SP-A, SP-A1, SPA, SPA1, surfactant protein A1, SP-A1 beta, SP-A1 delta, SP-A1 gamma, SP-A1 epsilon, ILD1
Зовнішні ІД	OMIM: 178630 MGI: 109518 HomoloGene: 3946 GeneCards: SFTPA1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • lipid transporter activity • lipopolysaccharide binding • monosaccharide binding Клітинна компонента • extracellular region • clathrin-coated endocytic vesicle • колаген • lamellar granule • endoplasmic reticulum membrane • міжклітинний простір • multivesicular body • rough endoplasmic reticulum Біологічний процес • respiratory gaseous exchange by respiratory system • lipid transport • toll-like receptor signaling pathway • Опсонізація • surfactant homeostasis • positive regulation of phagocytosis • GO:0007571 розвойовий процес Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	653509	20387
Ensembl	ENSG00000122852	ENSMUSG00000021789
UniProt	Q8IWL2	P35242 Q9CQI1
RefSeq (мРНК)	NM_001093770 NM_001164644 NM_001164645 NM_001164646 NM_001164647 NM_005411	NM_023134
RefSeq (білок)	NP_001087239 NP_001158116 NP_001158117 NP_001158118 NP_001158119 NP_005402	NP_075623
Локус (UCSC)	Хр. 10: 79.61 – 79.62 Mb	Хр. 14: 40.85 – 40.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWLCPLALNL		ILMAASGAVC		EVKDVCVGSP		GIPGTPGSHG		LPGRDGRDGL
KGDPGPPGPM		GPPGEMPCPP		GNDGLPGAPG		IPGECGEKGE		PGERGPPGLP
AHLDEELQAT		LHDFRHQILQ		TRGALSLQGS		IMTVGEKVFS		SNGQSITFDA
IQEACARAGG		RIAVPRNPEE		NEAIASFVKK		YNTYAYVGLT		EGPSPGDFRY
SDGTPVNYTN		WYRGEPAGRG		KEQCVEMYTD		GQWNDRNCLY		SRLTICEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Silveyra P., Wang G., Floros J. (2010). Human SP-A1 (SFTPA1) variant-specific 3' UTRs and poly(A) tail differentially affect the in vitro translation of a reporter gene. Am. J. Physiol. 299: L523—L534. PMID 20693318 DOI:10.1152/ajplung.00113.2010
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Floros J., Hoover R.R. (1998). Genetics of the hydrophilic surfactant proteins A and D. Biochim. Biophys. Acta. 1408: 312—322. PMID 9813381 DOI:10.1016/S0925-4439(98)00077-5
• Raemet M., Haataja R., Marttila R., Floros J., Hallman M. (2000). Association between the surfactant protein A (SP-A) gene locus and respiratory-distress syndrome in the Finnish population. Am. J. Hum. Genet. 66: 1569—1579. PMID 10762543 DOI:10.1086/302906
• Ragas A., Roussel L., Puzo G., Riviere M. (2007). The Mycobacterium tuberculosis cell-surface glycoprotein Apa as a potential adhesin to colonize target cells via the innate immune system pulmonary C-type lectin surfactant protein A. J. Biol. Chem. 282: 5133—5142. PMID 17158455 DOI:10.1074/jbc.M610183200

Див. також

• Хромосома 10