SFMBT1

SFMBT1
Ідентифікатори
Символи	SFMBT1, RU1, SFMBT, hSFMBT, Scm-like with four mbt domains 1, Scm like with four mbt domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607319 MGI: 1859609 HomoloGene: 9472 GeneCards: SFMBT1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0031493 histone binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of muscle organ development; • диференціація клітин; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • Сперматогенез; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51460
	54650
	ENSG00000163935
	ENSMUSG00000006527
	Q9UHJ3
	Q9JMD1
	NM_001005158; NM_001005159; NM_016329
	NM_001166531; NM_001166532; NM_019460; NM_175254
	NP_057413
	NP_001160003; NP_001160004; NP_062333
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SFMBT1 (англ. Scm like with four mbt domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 866 амінокислот, а молекулярна маса — 98 141^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGEQQLDAD	AGSGMEEVEL	SWEDYLEETG	STAVPYGSFK	HVDTRLQNGF
APGMKLEVAV	RTDPETYWVA	TVITTCEQLL	LLRYDGYGED	RRADFWCDIR
KADLYPIGWC	EQNKKTLEAP	EGIRDKVSDW	DEFLRQTLIG	ACSPPVPLLE
GLRNGRNPLD	LIAPGSRLEC	QAFQDSLSTW	IVTVVENIGG	RLKLRYEGLE
SSDNYEHWLY	YLDPFLHHVG	WAAQQGYELQ	PPSAIRHLKN	EAEWQEILAK
VKEEEEEPLP	SYLFKDKQVI	GIHTFSVNMK	LEAVDPWSPF	GISPATVVKV
FDEKYFLVEM	DDLRPENHAR	RSFVCHADSP	GIFPVQWSLK	NGLHISPPPG
YPSQDFDWAD	YLKQCGAEAA	PQRCFPPLIS	EHEFKENMKL	EAVNPILPEE
VCVATITAVR	GSYLWLQLEG	SKKPIPECIV	SVESMDIFPL	GWCETNGHPL
STPRRARVYK	QRKIAVVQPE	KQVPSSRTVH	EGLRNQELNS	TESVMINGKY
CCPKIYFNHR	CFSGPYLNKG	RIAELPQCVG	PGNCVLVLRE	VLTLLINAAY
KPSRVLRELQ	LDKDSVWHGC	GEVLKAKYKG	KSYRATVEIV	KTADRVTEFC
RQTCIKLECC	PNLFGPRMVL	DKCSENCSVL	TKTKYTHYYG	KKKNKRIGRP
PGGHSNLACA	LKKASKRRKR	RKNVFVHKKK	RSSASVDNTP	AGSPQGSGGE
DEDDPDEGDD	DSLSEGSTSE	QQDELQEESE	MSEKKSCSSS	PTQSEISTSL
PPDRQRRKRE	LRTFSFSDDE	NKPPSPKEIR	IEVAERLHLD	SNPLKWSVAD
VVRFIRSTDC	APLARIFLDQ	EIDGQALLLL	TLPTVQECMD	LKLGPAIKLC
HHIERIKFAF	YEQFAN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wu S., Trievel R.C., Rice J.C. (2007). Human SFMBT is a transcriptional repressor protein that selectively binds the N-terminal tail of histone H3. FEBS Lett. 581: 3289—3296. PMID 17599839 DOI:10.1016/j.febslet.2007.06.025

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20255 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UHJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20255 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UHJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]