SF3B3

SF3B3 (англ. Splicing factor 3b subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 217 амінокислот, а молекулярна маса — 135 577.

SF3B3
Ідентифікатори
Символи	SF3B3, RSE1, SAP130, SF3b130, STAF130, splicing factor 3b subunit 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605592 MGI: 1289341 HomoloGene: 6579 GeneCards: SF3B3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • U12-type spliceosomal complex • ядерце • small nuclear ribonucleoprotein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23450	101943
Ensembl	ENSG00000189091	ENSMUSG00000033732
UniProt	Q15393	Q921M3
RefSeq (мРНК)	NM_012426	NM_133953
RefSeq (білок)	NP_036558	NP_598714
Локус (UCSC)	Хр. 16: 70.52 – 70.58 Mb	Хр. 8: 111.54 – 111.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFLYNLTLQR		ATGISFAIHG		NFSGTKQQEI		VVSRGKILEL		LRPDPNTGKV
HTLLTVEVFG		VIRSLMAFRL		TGGTKDYIVV		GSDSGRIVIL		EYQPSKNMFE
KIHQETFGKS		GCRRIVPGQF		LAVDPKGRAV		MISAIEKQKL		VYILNRDAAA
RLTISSPLEA		HKANTLVYHV		VGVDVGFENP		MFACLEMDYE		EADNDPTGEA
AANTQQTLTF		YELDLGLNHV		VRKYSEPLEE		HGNFLITVPG		GSDGPSGVLI
CSENYITYKN		FGDQPDIRCP		IPRRRNDLDD		PERGMIFVCS		ATHKTKSMFF
FLAQTEQGDI		FKITLETDED		MVTEIRLKYF		DTVPVAAAMC		VLKTGFLFVA
SEFGNHYLYQ		IAHLGDDDEE		PEFSSAMPLE		EGDTFFFQPR		PLKNLVLVDE
LDSLSPILFC		QIADLANEDT		PQLYVACGRG		PRSSLRVLRH		GLEVSEMAVS
ELPGNPNAVW		TVRRHIEDEF		DAYIIVSFVN		ATLVLSIGET		VEEVTDSGFL
GTTPTLSCSL		LGDDALVQVY		PDGIRHIRAD		KRVNEWKTPG		KKTIVKCAVN
QRQVVIALTG		GELVYFEMDP		SGQLNEYTER		KEMSADVVCM		SLANVPPGEQ
RSRFLAVGLV		DNTVRIISLD		PSDCLQPLSM		QALPAQPESL		CIVEMGGTEK
QDELGERGSI		GFLYLNIGLQ		NGVLLRTVLD		PVTGDLSDTR		TRYLGSRPVK
LFRVRMQGQE		AVLAMSSRSW		LSYSYQSRFH		LTPLSYETLE		FASGFASEQC
PEGIVAISTN		TLRILALEKL		GAVFNQVAFP		LQYTPRKFVI		HPESNNLIII
ETDHNAYTEA		TKAQRKQQMA		EEMVEAAGED		ERELAAEMAA		AFLNENLPES
IFGAPKAGNG		QWASVIRVMN		PIQGNTLDLV		QLEQNEAAFS		VAVCRFSNTG
EDWYVLVGVA		KDLILNPRSV		AGGFVYTYKL		VNNGEKLEFL		HKTPVEEVPA
AIAPFQGRVL		IGVGKLLRVY		DLGKKKLLRK		CENKHIANYI		SGIQTIGHRV
IVSDVQESFI		WVRYKRNENQ		LIIFADDTYP		RWVTTASLLD		YDTVAGADKF
GNICVVRLPP		NTNDEVDEDP		TGNKALWDRG		LLNGASQKAE		VIMNYHVGET
VLSLQKTTLI		PGGSESLVYT		TLSGGIGILV		PFTSHEDHDF		FQHVEMHLRS
EHPPLCGRDH		LSFRSYYFPV		KNVIDGDLCE		QFNSMEPNKQ		KNVSEELDRT
PPEVSKKLED		IRTRYAF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155

Див. також

• Хромосома 16