SF3B2

SF3B2 (англ. Splicing factor 3b subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 895 амінокислот, а молекулярна маса — 100 228.

SF3B2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DO5
Ідентифікатори
Символи	SF3B2, Cus1, SAP145, SF3B145, SF3b1, SF3b150, splicing factor 3b subunit 2, CFM
Зовнішні ІД	OMIM: 605591 MGI: 2441856 HomoloGene: 6678 GeneCards: SF3B2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • U2-type spliceosomal complex • U12-type spliceosomal complex • precatalytic spliceosome • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • nuclear speck • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0022415 viral process • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10992	319322
Ensembl	ENSG00000087365	ENSMUSG00000024853
UniProt	Q13435	Q3UJB0
RefSeq (мРНК)	NM_006842	NM_030109 NM_001362454
RefSeq (білок)	NP_006833	NP_084385 NP_001349383
Локус (UCSC)	Хр. 11: 66.05 – 66.07 Mb	Хр. 19: 5.32 – 5.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATEHPEPPK		AELQLPPPPP		PGHYGAWAAQ		ELQAKLAEIG		APIQGNREEL
VERLQSYTRQ		TGIVLNRPVL		RGEDGDKAAP		PPMSAQLPGI		PMPPPPLGLP
PLQPPPPPPP		PPPGLGLGFP		MAHPPNLGPP		PPLRVGEPVA		LSEEERLKLA
QQQAALLMQQ		EERAKQQGDH		SLKEHELLEQ		QKRAAVLLEQ		ERQQEIAKMG
TPVPRPPQDM		GQIGVRTPLG		PRVAAPVGPV		GPTPTVLPMG		APVPRPRGPP
PPPGDENREM		DDPSVGPKIP		QALEKILQLK		ESRQEEMNSQ		QEEEEMETDA
RSSLGQSASE		TEEDTVSVSK		KEKNRKRRNR		KKKKKPQRVR		GVSSESSGDR
EKDSTRSRGS		DSPAADVEIE		YVTEEPEIYE		PNFIFFKRIF		EAFKLTDDVK
KEKEKEPEKL		DKLENSAAPK		KKGFEEEHKD		SDDDSSDDEQ		EKKPEAPKLS
KKKLRRMNRF		TVAELKQLVA		RPDVVEMHDV		TAQDPKLLVH		LKATRNSVPV
PRHWCFKRKY		LQGKRGIEKP		PFELPDFIKR		TGIQEMREAL		QEKEEQKTMK
SKMREKVRPK		MGKIDIDYQK		LHDAFFKWQT		KPKLTIHGDL		YYEGKEFETR
LKEKKPGDLS		DELRISLGMP		VGPNAHKVPP		PWLIAMQRYG		PPPSYPNLKI
PGLNSPIPES		CSFGYHAGGW		GKPPVDETGK		PLYGDVFGTN		AAEFQTKTEE
EEIDRTPWGE		LEPSDEESSE		EEEEEESDED		KPDETGFITP		ADSGLITPGG
FSSVPAGMET		PELIELRKKK		IEEAMDGSET		PQLFTVLPEK		RTATVGGAMM
GSTHIYDMST		VMSRKGPAPE		LQGVEVALAP		EELELDPMAM		TQKYEEHVRE
QQAQVEKEDF		SDMVAEHAAK		QKQKKRKAQP		QDSRGGSKKY		KEFKF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gozani O., Feld R., Reed R. (1996). Evidence that sequence-independent binding of highly conserved U2 snRNP proteins upstream of the branch site is required for assembly of spliceosomal complex A. Genes Dev. 10: 233—243. PMID 8566756 DOI:10.1101/gad.10.2.233
• Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155
• Terada Y., Yasuda Y. (2006). Human immunodeficiency virus type 1 Vpr induces G2 checkpoint activation by interacting with the splicing factor SAP145. Mol. Cell. Biol. 26: 8149—8158. PMID 16923959 DOI:10.1128/MCB.01170-06

Див. також

• Хромосома 11