SEMA6D

SEMA6D
Ідентифікатори
Символи	SEMA6D, semaphorin 6D
Зовнішні ІД	OMIM: 609295 MGI: 2387661 HomoloGene: 16195 GeneCards: SEMA6D
Пов'язані генетичні захворювання
	ішемічна хвороба серця, харчові розлади
Онтологія гена
Молекулярна функція	• semaphorin receptor binding; • neuropilin binding; • chemorepellent activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• positive regulation of smooth muscle cell migration; • multicellular organism development; • диференціація клітин; • negative regulation of smooth muscle cell migration; • ventricular system development; • нейробіологія розвитку; • negative regulation of axon extension; • neural crest cell migration; • positive regulation of cell migration; • negative regulation of axon extension involved in axon guidance; • negative chemotaxis; • semaphorin-plexin signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	80031
	214968
	ENSG00000137872
	ENSMUSG00000027200
	Q8NFY4
	Q76KF0
NM_001198999; NM_020858; NM_024966; NM_153616; NM_153617;
	NM_153618; NM_153619; NM_001358351; NM_001358352
NM_001290997; NM_001291000; NM_172537; NM_199238; NM_199239;
	NM_199240; NM_199241
NP_001185928; NP_065909; NP_079242; NP_705869; NP_705870;
	NP_705871; NP_705872; NP_001345280; NP_001345281
NP_001277926; NP_001277929; NP_766125; NP_954708; NP_954709;
	NP_954710; NP_954711; NP_001394214
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SEMA6D (англ. Semaphorin 6D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 073 амінокислот, а молекулярна маса — 119 872^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVFLLCAYI	LLLMVSQLRA	VSFPEDDEPL	NTVDYHYSRQ	YPVFRGRPSG
NESQHRLDFQ	LMLKIRDTLY	IAGRDQVYTV	NLNEMPKTEV	IPNKKLTWRS
RQQDRENCAM	KGKHKDECHN	FIKVFVPRND	EMVFVCGTNA	FNPMCRYYRL
STLEYDGEEI	SGLARCPFDA	RQTNVALFAD	GKLYSATVAD	FLASDAVIYR
SMGDGSALRT	IKYDSKWIKE	PHFLHAIEYG	NYVYFFFREI	AVEHNNLGKA
VYSRVARICK	NDMGGSQRVL	EKHWTSFLKA	RLNCSVPGDS	FFYFDVLQSI
TDIIQINGIP	TVVGVFTTQL	NSIPGSAVCA	FSMDDIEKVF	KGRFKEQKTP
DSVWTAVPED	KVPKPRPGCC	AKHGLAEAYK	TSIDFPDETL	SFIKSHPLMD
SAVPPIADEP	WFTKTRVRYR	LTAISVDHSA	GPYQNYTVIF	VGSEAGMVLK
VLAKTSPFSL	NDSVLLEEIE	AYNHAKCSAE	NEEDKKVISL	QLDKDHHALY
VAFSSCIIRI	PLSRCERYGS	CKKSCIASRD	PYCGWLSQGS	CGRVTPGMLA
EGYEQDTEFG	NTAHLGDCHE	ILPTSTTPDY	KIFGGPTSDM	EVSSSSVTTM
ASIPEITPKV	IDTWRPKLTS	SRKFVVQDDP	NTSDFTDPLS	GIPKGVRWEV
QSGESNQMVH	MNVLITCVFA	AFVLGAFIAG	VAVYCYRDMF	VRKNRKIHKD
AESAQSCTDS	SGSFAKLNGL	FDSPVKEYQQ	NIDSPKLYSN	LLTSRKELPP
NGDTKSMVMD	HRGQPPELAA	LPTPESTPVL	HQKTLQAMKS	HSEKAHGHGA
SRKETPQFFP	SSPPPHSPLS	HGHIPSAIVL	PNATHDYNTS	FSNSNAHKAE
KKLQNIDHPL	TKSSSKRDHR	RSVDSRNTLN	DLLKHLNDPN	SNPKAIMGDI
QMAHQNLMLD	PMGSMSEVPP	KVPNREASLY	SPPSTLPRNS	PTKRVDVPTT
PGVPMTSLER	QRGYHKNSSQ	RHSISAMPKN	LNSPNGVLLS	RQPSMNRGGY
MPTPTGAKVD	YIQGTPVSVH	LQPSLSRQSS	YTSNGTLPRT	GLKRTPSLKP
DVPPKPSFVP	QTPSVRPLNK	YTY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література ред.

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504