SEMA6C

SEMA6C (англ. Semaphorin 6C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 99 686.

SEMA6C
Ідентифікатори
Символи	SEMA6C, SEMAY, m-SemaY, m-SemaY2, semaphorin 6C, Sema-Y
Зовнішні ІД	OMIM: 609294 MGI: 1338032 HomoloGene: 7931 GeneCards: SEMA6C
Онтологія гена Молекулярна функція • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity • neuropilin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • цитоплазма • cell surface • міжклітинний простір Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • axon guidance • negative regulation of axon extension • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • negative chemotaxis • semaphorin-plexin signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10500	20360
Ensembl	ENSG00000143434	ENSMUSG00000038777
UniProt	Q9H3T2	Q9WTM3
RefSeq (мРНК)	NM_001178061 NM_001178062 NM_030913	NM_001272024 NM_011351
RefSeq (білок)	NP_001171532 NP_001171533 NP_112175	NP_001258953 NP_035481
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.13 – 151.15 Mb	Хр. 3: 95.16 – 95.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRAPHFMPL		LLLLLLLSLP		HTQAAFPQDP		LPLLISDLQG		TSPLSWFRGL
EDDAVAAELG		LDFQRFLTLN		RTLLVAARDH		VFSFDLQAEE		EGEGLVPNKY
LTWRSQDVEN		CAVRGKLTDE		CYNYIRVLVP		WDSQTLLACG		TNSFSPVCRS
YGITSLQQEG		EELSGQARCP		FDATQSNVAI		FAEGSLYSAT		AADFQASDAV
VYRSLGPQPP		LRSAKYDSKW		LREPHFVQAL		EHGDHVYFFF		REVSVEDARL
GRVQFSRVAR		VCKRDMGGSP		RALDRHWTSF		LKLRLNCSVP		GDSTFYFDVL
QALTGPVNLH		GRSALFGVFT		TQTNSIPGSA		VCAFYLDEIE		RGFEGKFKEQ
RSLDGAWTPV		SEDRVPSPRP		GSCAGVGGAA		LFSSSRDLPD		DVLTFIKAHP
LLDPAVPPVT		HQPLLTLTSR		ALLTQVAVDG		MAGPHSNITV		MFLGSNDGTV
LKVLTPGGRS		GGPEPILLEE		IDAYSPARCS		GKRTAQTARR		IIGLELDTEG
HRLFVAFSGC		IVYLPLSRCA		RHGACQRSCL		ASQDPYCGWH		SSRGCVDIRG
SGGTDVDQAG		NQESMEHGDC		QDGATGSQSG		PGDSAYGVRR		DLPPASASRS
VPIPLLLASV		AAAFALGASV		SGLLVSCACR		RAHRRRGKDI		ETPGLPRPLS
LRSLARLHGG		GPEPPPPSKD		GDAVQTPQLY		TTFLPPPEGV		PPPELACLPT
PESTPELPVK		HLRAAGDPWE		WNQNRNNAKE		GPGRSRGGHA		AGGPAPRVLV
RPPPPGCPGQ		AVEVTTLEEL		LRYLHGPQPP		RKGAEPPAPL		TSRALPPEPA
PALLGGPSPR		PHECASPLRL		DVPPEGRCAS		APARPALSAP		APRLGVGGGR
RLPFSGHRAP		PALLTRVPSG		GPSRYSGGPG		KHLLYLGRPE		GYRGRALKRV
DVEKPQLSLK		PPLVGPSSRQ		AVPNGGRFNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Див. також

• Хромосома 1