SEMA6B

SEMA6B (англ. Semaphorin 6B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 888 амінокислот, а молекулярна маса — 95 285.

SEMA6B
Ідентифікатори
Символи	SEMA6B, SEM-SEMA-Y, SEMA-VIB, SEMAN, semaZ, semaphorin 6B, EPM11, SEM-SEMA-Z
Зовнішні ІД	OMIM: 608873 MGI: 1202889 HomoloGene: 8428 GeneCards: SEMA6B
Онтологія гена Молекулярна функція • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • negative chemotaxis • semaphorin-plexin signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10501	20359
Ensembl	ENSG00000167680	ENSMUSG00000001227
UniProt	Q9H3T3	O54951
RefSeq (мРНК)	NM_020241 NM_032108 NM_133327	NM_001130456 NM_013662
RefSeq (білок)	NP_115484	NP_001123928 NP_038690
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.54 – 4.58 Mb	Хр. 17: 56.43 – 56.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQTPRASPPR		PALLLLLLLL		GGAHGLFPEE		PPPLSVAPRD		YLNHYPVFVG
SGPGRLTPAE		GADDLNIQRV		LRVNRTLFIG		DRDNLYRVEL		EPPTSTELRY
QRKLTWRSNP		SDINVCRMKG		KQEGECRNFV		KVLLLRDEST		LFVCGSNAFN
PVCANYSIDT		LQPVGDNISG		MARCPYDPKH		ANVALFSDGM		LFTATVTDFL
AIDAVIYRSL		GDRPTLRTVK		HDSKWFKEPY		FVHAVEWGSH		VYFFFREIAM
EFNYLEKVVV		SRVARVCKND		VGGSPRVLEK		QWTSFLKARL		NCSVPGDSHF
YFNVLQAVTG		VVSLGGRPVV		LAVFSTPSNS		IPGSAVCAFD		LTQVAAVFEG
RFREQKSPES		IWTPVPEDQV		PRPRPGCCAA		PGMQYNASSA		LPDDILNFVK
THPLMDEAVP		SLGHAPWILR		TLMRHQLTRV		AVDVGAGPWG		NQTVVFLGSE
AGTVLKFLVR		PNASTSGTSG		LSVFLEEFET		YRPDRCGRPG		GGETGQRLLS
LELDAASGGL		LAAFPRCVVR		VPVARCQQYS		GCMKNCIGSQ		DPYCGWAPDG
SCIFLSPGTR		AAFEQDVSGA		STSGLGDCTG		LLRASLSEDR		AGLVSVNLLV
TSSVAAFVVG		AVVSGFSVGW		FVGLRERREL		ARRKDKEAIL		AHGAGEAVLS
VSRLGERRAQ		GPGGRGGGGG		GGAGVPPEAL		LAPLMQNGWA		KATLLQGGPH
DLDSGLLPTP		EQTPLPQKRL		PTPHPHPHAL		GPRAWDHGHP		LLPASASSSL
LLLAPARAPE		QPPAPGEPTP		DGRLYAARPG		RASHGDFPLT		PHASPDRRRV
VSAPTGPLDP		ASAADGLPRP		WSPPPTGSLR		RPLGPHAPPA		ATLRRTHTFN
SGEARPGDRH		RGCHARPGTD		LAHLLPYGGA		DRTAPPVP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 19