SEMA6A

SEMA6A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3AFC, 3AL8, 3OKW, 3OKY
Ідентифікатори
Символи	SEMA6A, HT018, SEMA, SEMA6A1, SEMAQ, VIA, semaphorin 6A
Зовнішні ІД	OMIM: 605885 MGI: 1203727 HomoloGene: 32426 GeneCards: SEMA6A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • semaphorin receptor binding; • chemorepellent activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • аксон; • клітинна мембрана; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• animal organ morphogenesis; • multicellular organism development; • cell surface receptor signaling pathway; • диференціація клітин; • cytoskeleton organization; • нейробіологія розвитку; • GO:0097285 апоптоз; • axon guidance; • positive regulation of neuron migration; • negative regulation of sprouting angiogenesis; • negative regulation of angiogenesis; • negative regulation of cell adhesion involved in sprouting angiogenesis; • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • negative regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway; • neural crest cell migration; • positive regulation of cell migration; • negative regulation of axon extension involved in axon guidance; • negative chemotaxis; • semaphorin-plexin signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	57556
	20358
	ENSG00000092421
	ENSMUSG00000019647
	Q9H2E6
	O35464
	NM_001300780; NM_020681; NM_020796
	NM_018744; NM_001311097
	NP_001287709; NP_065847
	NP_001298026; NP_061214
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SEMA6A (англ. Semaphorin 6A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 030 амінокислот, а молекулярна маса — 114 395^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRSEALLLYF	TLLHFAGAGF	PEDSEPISIS	HGNYTKQYPV	FVGHKPGRNT
TQRHRLDIQM	IMIMNGTLYI	AARDHIYTVD	IDTSHTEEIY	CSKKLTWKSR
QADVDTCRMK	GKHKDECHNF	IKVLLKKNDD	ALFVCGTNAF	NPSCRNYKMD
TLEPFGDEFS	GMARCPYDAK	HANVALFADG	KLYSATVTDF	LAIDAVIYRS
LGESPTLRTV	KHDSKWLKEP	YFVQAVDYGD	YIYFFFREIA	VEYNTMGKVV
FPRVAQVCKN	DMGGSQRVLE	KQWTSFLKAR	LNCSVPGDSH	FYFNILQAVT
DVIRINGRDV	VLATFSTPYN	SIPGSAVCAY	DMLDIASVFT	GRFKEQKSPD
STWTPVPDER	VPKPRPGCCA	GSSSLERYAT	SNEFPDDTLN	FIKTHPLMDE
AVPSIFNRPW	FLRTMVRYRL	TKIAVDTAAG	PYQNHTVVFL	GSEKGIILKF
LARIGNSGFL	NDSLFLEEMS	VYNSEKCSYD	GVEDKRIMGM	QLDRASSSLY
VAFSTCVIKV	PLGRCERYGK	CKKTCIASRD	PYCGWIKEGG	ACSHLSPNSR
LTFEQDIERG	NTDGLGDCHN	SFVALNGHSS	SLLPSTTTSD	STAQEGYESR
GGMLDWKHLL	DSPDSTDPLG	AVSSHNHQDK	KGVIRESYLK	GHDQLVPVTL
LAIAVILAFV	MGAVFSGITV	YCVCDHRRKD	VAVVQRKEKE	LTHSRRGSMS
SVTKLSGLFG	DTQSKDPKPE	AILTPLMHNG	KLATPGNTAK	MLIKADQHHL
DLTALPTPES	TPTLQQKRKP	SRGSREWERN	QNLINACTKD	MPPMGSPVIP
TDLPLRASPS	HIPSVVVLPI	TQQGYQHEYV	DQPKMSEVAQ	MALEDQAATL
EYKTIKEHLS	SKSPNHGVNL	VENLDSLPPK	VPQREASLGP	PGASLSQTGL
SKRLEMHHSS	SYGVDYKRSY	PTNSLTRSHQ	ATTLKRNNTN	SSNSSHLSRN
QSFGRGDNPP	PAPQRVDSIQ	VHSSQPSGQA	VTVSRQPSLN	AYNSLTRSGL
KRTPSLKPDV	PPKPSFAPLS	TSMKPNDACT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література ред.

Klostermann A., Lutz B., Gertler F., Behl C. (2000). The orthologous human and murine semaphorin 6A-1 proteins (SEMA6A-1/Sema6A-1) bind to the enabled/vasodilator-stimulated phosphoprotein-like protein (EVL) via a novel carboxyl-terminal zyxin-like domain. J. Biol. Chem. 275: 39647—39653. PMID 10993894 DOI:10.1074/jbc.M006316200
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10738 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H2E6 (англ.) . Архів оригіналу за 10 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10738 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9H2E6 (англ.) . Архів оригіналу за 10 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]