SEMA4F

SEMA4F (англ. Ssemaphorin 4F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 770 амінокислот, а молекулярна маса — 83 511.

SEMA4F
Ідентифікатори
Символи	SEMA4F, M-SEMA, PRO2353, S4F, SEMAM, SEMAW, m-Sema-M, ssemaphorin 4F
Зовнішні ІД	OMIM: 603706 MGI: 1340055 HomoloGene: 3147 GeneCards: SEMA4F
Онтологія гена Молекулярна функція • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • cell projection • перикаріон Біологічний процес • диференціація клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку • axon guidance • multicellular organism development • negative regulation of axon extension • retinal ganglion cell axon guidance • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10505	20355
Ensembl	ENSG00000135622	ENSMUSG00000000627
UniProt	O95754	Q9Z123
RefSeq (мРНК)	NM_001271661 NM_001271662 NM_004263	NM_001113481 NM_011350 NM_001308374
RefSeq (білок)	NP_001258590 NP_001258591 NP_004254	NP_001295303 NP_035480
Локус (UCSC)	Хр. 2: 74.65 – 74.68 Mb	Хр. 6: 82.89 – 82.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPASAARPRP		GPGQPTASPF		PLLLLAVLSG		PVSGRVPRSV		PRTSLPISEA
DSCLTRFAVP		HTYNYSVLLV		DPASHTLYVG		ARDTIFALSL		PFSGERPRRI
DWMVPEAHRQ		NCRKKGKKED		ECHNFVQILA		IANASHLLTC		GTFAFDPKCG
VIDVSRFQQV		ERLESGRGKC		PFEPAQRSAA		VMAGGVLYAA		TVKNYLGTEP
IITRAVGRAE		DWIRTDTLPS		WLNAPAFVAA		VALSPAEWGD		EDGDDEIYFF
FTETSRAFDS		YERIKVPRVA		RVCAGDLGGR		KTLQQRWTTF		LKADLLCPGP
EHGRASSVLQ		DVAVLRPELG		AGTPIFYGIF		SSQWEGATIS		AVCAFRPQDI
RTVLNGPFRE		LKHDCNRGLP		VVDNDVPQPR		PGECITNNMK		LRHFGSSLSL
PDRVLTFIRD		HPLMDRPVFP		ADGHPLLVTT		DTAYLRVVAH		RVTSLSGKEY
DVLYLGTEDG		HLHRAVRIGA		QLSVLEDLAL		FPEPQPVENM		KLYHSWLLVG
SRTEVTQVNT		TNCGRLQSCS		ECILAQDPVC		AWSFRLDECV		AHAGEHRGLV
QDIESADVSS		LCPKEPGERP		VVFEVPVATA		AHVVLPCSPS		SAWASCVWHQ
PSGVTALTPR		RDGLEVVVTP		GAMGAYACEC		QEGGAAHVVA		AYSLVWGSQR
DAPSRAHTVG		AGLAGFFLGI		LAASLTLILI		GRRQQRRRQR		ELLARDKVGL
DLGAPPSGTT		SYSQDPPSPS		PEDERLPLAL		AKRGSGFGGF		SPPFLLDPCP
SPAHIRLTGA		PLATCDETSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2