SEMA4C

SEMA4C (англ. Semaphorin 4C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 833 амінокислот, а молекулярна маса — 92 623.

SEMA4C
Ідентифікатори
Символи	SEMA4C, M-SEMA-F, SEMACL1, SEMAF, SEMAI, semaphorin 4C
Зовнішні ІД	OMIM: 604462 MGI: 109252 HomoloGene: 23047 GeneCards: SEMA4C
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • integral component of membrane • postsynaptic membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинний простір • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • диференціація клітин • cell migration in hindbrain • cerebellum development • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • muscle cell differentiation • neural tube closure • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • semaphorin-plexin signaling pathway • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54910	20353
Ensembl	ENSG00000168758	ENSMUSG00000026121
UniProt	Q9C0C4	Q64151
RefSeq (мРНК)	NM_017789	NM_001126047 NM_001304329 NM_001304330
RefSeq (білок)	NP_060259	NP_001119519 NP_001291258 NP_001291259
Локус (UCSC)	Хр. 2: 96.86 – 96.87 Mb	Хр. 1: 36.59 – 36.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPHWAVWLL		AARLWGLGIG		AEVWWNLVPR		KTVSSGELAT		VVRRFSQTGI
QDFLTLTLTE		PTGLLYVGAR		EALFAFSMEA		LELQGAISWE		APVEKKTECI
QKGKNNQTEC		FNFIRFLQPY		NASHLYVCGT		YAFQPKCTYV		NMLTFTLEHG
EFEDGKGKCP		YDPAKGHAGL		LVDGELYSAT		LNNFLGTEPI		ILRNMGPHHS
MKTEYLAFWL		NEPHFVGSAY		VPESVGSFTG		DDDKVYFFFR		ERAVESDCYA
EQVVARVARV		CKGDMGGART		LQRKWTTFLK		ARLACSAPNW		QLYFNQLQAM
HTLQDTSWHN		TTFFGVFQAQ		WGDMYLSAIC		EYQLEEIQRV		FEGPYKEYHE
EAQKWDRYTD		PVPSPRPGSC		INNWHRRHGY		TSSLELPDNI		LNFVKKHPLM
EEQVGPRWSR		PLLVKKGTNF		THLVADRVTG		LDGATYTVLF		IGTGDGWLLK
AVSLGPWVHL		IEELQLFDQE		PMRSLVLSQS		KKLLFAGSRS		QLVQLPVADC
MKYRSCADCV		LARDPYCAWS		VNTSRCVAVG		GHSGSLLIQH		VMTSDTSGIC
NLRGSKKVRP		TPKNITVVAG		TDLVLPCHLS		SNLAHARWTF		GGRDLPAEQP
GSFLYDARLQ		ALVVMAAQPR		HAGAYHCFSE		EQGARLAAEG		YLVAVVAGPS
VTLEARAPLE		NLGLVWLAVV		ALGAVCLVLL		LLVLSLRRRL		REELEKGAKA
TERTLVYPLE		LPKEPTSPPF		RPCPEPDEKL		WDPVGYYYSD		GSLKIVPGHA
RCQPGGGPPS		PPPGIPGQPL		PSPTRLHLGG		GRNSNANGYV		RLQLGGEDRG
GLGHPLPELA		DELRRKLQQR		QPLPDSNPEE		SSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2