SEMA4A

SEMA4A
Ідентифікатори
Символи	SEMA4A, CORD10, RP35, SEMAB, SEMB, semaphorin 4A
Зовнішні ІД	OMIM: 607292 MGI: 107560 HomoloGene: 8425 GeneCards: SEMA4A
Пов'язані генетичні захворювання
	retinitis pigmentosa 35, cone-rod dystrophy 10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • neuropilin binding; • semaphorin receptor binding; • chemorepellent activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • клітинна мембрана; • міжклітинний простір; • мембрана; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • адаптивна імунна відповідь; • аксоноґенеза; • процес імунної системи; • T-helper 1 cell differentiation; • нейробіологія розвитку; • multicellular organism development; • Ангіогенез; • regulation of endothelial cell migration; • regulation of cell shape; • negative regulation of angiogenesis; • T cell differentiation involved in immune response; • semaphorin-plexin signaling pathway; • negative chemotaxis; • neural crest cell migration; • positive regulation of cell migration; • negative regulation of axon extension involved in axon guidance; • positive regulation of excitatory synapse assembly; • positive regulation of inhibitory synapse assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	64218
	20351
	ENSG00000196189
	ENSMUSG00000028064
	Q9H3S1
	Q62178
NM_001193300; NM_001193301; NM_001193302; NM_022367; NM_001370567;
	NM_001370568; NM_001370569; NM_001370571
	NM_001163489; NM_001163490; NM_001163491; NM_013658
NP_001180229; NP_001180230; NP_001180231; NP_071762; NP_001357496;
	NP_001357497; NP_001357498; NP_001357500
	NP_001156961; NP_001156962; NP_001156963; NP_038686
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SEMA4A (англ. Semaphorin 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 761 амінокислот, а молекулярна маса — 83 574^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALPALGLDP	WSLLGLFLFQ	LLQLLLPTTT	AGGGGQGPMP	RVRYYAGDER
RALSFFHQKG	LQDFDTLLLS	GDGNTLYVGA	REAILALDIQ	DPGVPRLKNM
IPWPASDRKK	SECAFKKKSN	ETQCFNFIRV	LVSYNVTHLY	TCGTFAFSPA
CTFIELQDSY	LLPISEDKVM	EGKGQSPFDP	AHKHTAVLVD	GMLYSGTMNN
FLGSEPILMR	TLGSQPVLKT	DNFLRWLHHD	ASFVAAIPST	QVVYFFFEET
ASEFDFFERL	HTSRVARVCK	NDVGGEKLLQ	KKWTTFLKAQ	LLCTQPGQLP
FNVIRHAVLL	PADSPTAPHI	YAVFTSQWQV	GGTRSSAVCA	FSLLDIERVF
KGKYKELNKE	TSRWTTYRGP	ETNPRPGSCS	VGPSSDKALT	FMKDHFLMDE
QVVGTPLLVK	SGVEYTRLAV	ETAQGLDGHS	HLVMYLGTTT	GSLHKAVVSG
DSSAHLVEEI	QLFPDPEPVR	NLQLAPTQGA	VFVGFSGGVW	RVPRANCSVY
ESCVDCVLAR	DPHCAWDPES	RTCCLLSAPN	LNSWKQDMER	GNPEWACASG
PMSRSLRPQS	RPQIIKEVLA	VPNSILELPC	PHLSALASYY	WSHGPAAVPE
ASSTVYNGSL	LLIVQDGVGG	LYQCWATENG	FSYPVISYWV	DSQDQTLALD
PELAGIPREH	VKVPLTRVSG	GAALAAQQSY	WPHFVTVTVL	FALVLSGALI
ILVASPLRAL	RARGKVQGCE	TLRPGEKAPL	SREQHLQSPK	ECRTSASDVD
ADNNCLGTEV	A

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, ангіогенез, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Abid A., Ismail M., Mehdi S.Q., Khaliq S. (2006). Identification of novel mutations in the SEMA4A gene associated with retinal degenerative diseases. J. Med. Genet. 43: 378—381. PMID 16199541 DOI:10.1136/jmg.2005.035055