SEMA3D

SEMA3D (англ. Semaphorin 3D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 777 амінокислот, а молекулярна маса — 89 651.

SEMA3D
Ідентифікатори
Символи	SEMA3D, Sema-Z2, coll-2, semaphorin 3D
Зовнішні ІД	OMIM: 609907 MGI: 1860118 HomoloGene: 23664 GeneCards: SEMA3D
Онтологія гена Молекулярна функція • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway • axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	223117	108151
Ensembl	ENSG00000153993	ENSMUSG00000040254
UniProt	O95025	Q8BH34
RefSeq (мРНК)	NM_152754	NM_028882
RefSeq (білок)	NP_689967	NP_083158
Локус (UCSC)	Хр. 7: 85 – 85.19 Mb	Хр. 5: 12.43 – 12.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNANKDERLK		ARSQDFHLFP		ALMMLSMTML		FLPVTGTLKQ		NIPRLKLTYK
DLLLSNSCIP		FLGSSEGLDF		QTLLLDEERG		RLLLGAKDHI		FLLSLVDLNK
NFKKIYWPAA		KERVELCKLA		GKDANTECAN		FIRVLQPYNK		THIYVCGTGA
FHPICGYIDL		GVYKEDIIFK		LDTHNLESGR		LKCPFDPQQP		FASVMTDEYL
YSGTASDFLG		KDTAFTRSLG		PTHDHHYIRT		DISEHYWLNG		AKFIGTFFIP
DTYNPDDDKI		YFFFRESSQE		GSTSDKTILS		RVGRVCKNDV		GGQRSLINKW
TTFLKARLIC		SIPGSDGADT		YFDELQDIYL		LPTRDERNPV		VYGVFTTTSS
IFKGSAVCVY		SMADIRAVFN		GPYAHKESAD		HRWVQYDGRI		PYPRPGTCPS
KTYDPLIKST		RDFPDDVISF		IKRHSVMYKS		VYPVAGGPTF		KRINVDYRLT
QIVVDHVIAE		DGQYDVMFLG		TDIGTVLKVV		SISKEKWNME		EVVLEELQIF
KHSSIILNME		LSLKQQQLYI		GSRDGLVQLS		LHRCDTYGKA		CADCCLARDP
YCAWDGNACS		RYAPTSKRRA		RRQDVKYGDP		ITQCWDIEDS		ISHETADEKV
IFGIEFNSTF		LECIPKSQQA		TIKWYIQRSG		DEHREELKPD		ERIIKTEYGL
LIRSLQKKDS		GMYYCKAQEH		TFIHTIVKLT		LNVIENEQME		NTQRAEHEEG
KVKDLLAESR		LRYKDYIQIL		SSPNFSLDQY		CEQMWHREKR		RQRNKGGPKW
KHMQEMKKKR		NRRHHRDLDE		LPRAVAT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7