SEMA3C

SEMA3C (англ. Semaphorin 3C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 751 амінокислот, а молекулярна маса — 85 207.

SEMA3C
Ідентифікатори
Символи	SEMA3C, SEMAE, SemE, semaphorin 3C
Зовнішні ІД	OMIM: 602645 MGI: 107557 HomoloGene: 36201 GeneCards: SEMA3C
Онтологія гена Молекулярна функція • semaphorin receptor binding • neuropilin binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane Біологічний процес • somitogenesis • диференціація клітин • limb bud formation • outflow tract morphogenesis • post-embryonic development • нейробіологія розвитку • axon guidance • multicellular organism development • heart development • blood vessel remodeling • pulmonary myocardium development • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • neural tube development • dichotomous subdivision of terminal units involved in salivary gland branching • cardiac right ventricle morphogenesis • neural crest cell migration • negative chemotaxis • outflow tract septum morphogenesis • semaphorin-plexin signaling pathway • cardiac endothelial to mesenchymal transition • positive regulation of cardiac neural crest cell migration involved in outflow tract morphogenesis • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10512	20348
Ensembl	ENSG00000075223	ENSMUSG00000028780
UniProt	Q99985	Q62181
RefSeq (мРНК)	NM_006379 NM_001350120 NM_001350121	NM_013657
RefSeq (білок)	NP_006370 NP_001337049 NP_001337050	NP_038685
Локус (UCSC)	Хр. 7: 80.74 – 80.92 Mb	Хр. 5: 17.78 – 17.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFRTICVLV		GVFICSICVK		GSSQPQARVY		LTFDELRETK		TSEYFSLSHH
PLDYRILLMD		EDQDRIYVGS		KDHILSLNIN		NISQEALSVF		WPASTIKVEE
CKMAGKDPTH		GCGNFVRVIQ		TFNRTHLYVC		GSGAFSPVCT		YLNRGRRSED
QVFMIDSKCE		SGKGRCSFNP		NVNTVSVMIN		EELFSGMYID		FMGTDAAIFR
SLTKRNAVRT		DQHNSKWLSE		PMFVDAHVIP		DGTDPNDAKV		YFFFKEKLTD
NNRSTKQIHS		MIARICPNDT		GGLRSLVNKW		TTFLKARLVC		SVTDEDGPET
HFDELEDVFL		LETDNPRTTL		VYGIFTTSSS		VFKGSAVCVY		HLSDIQTVFN
GPFAHKEGPN		HQLISYQGRI		PYPRPGTCPG		GAFTPNMRTT		KEFPDDVVTF
IRNHPLMYNS		IYPIHKRPLI		VRIGTDYKYT		KIAVDRVNAA		DGRYHVLFLG
TDRGTVQKVV		VLPTNNSVSG		ELILEELEVF		KNHAPITTMK		ISSKKQQLYV
SSNEGVSQVS		LHRCHIYGTA		CADCCLARDP		YCAWDGHSCS		RFYPTGKRRS
RRQDVRHGNP		LTQCRGFNLK		AYRNAAEIVQ		YGVKNNTTFL		ECAPKSPQAS
IKWLLQKDKD		RRKEVKLNER		IIATSQGLLI		RSVQGSDQGL		YHCIATENSF
KQTIAKINFK		VLDSEMVAVV		TDKWSPWTWA		SSVRALPFHP		KDIMGAFSHS
EMQMINQYCK		DTRQQHQQGD		ESQKMRGDYG		KLKALINSRK		SRNRRNQLPE
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Yamada T., Endo R., Gotoh M., Hirohashi S. (1997). Identification of semaphorin E as a non-MDR drug resistance gene of human cancers. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 14713—14718. PMID 9405678 DOI:10.1073/pnas.94.26.14713
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7