SEMA3B

SEMA3B (англ. Semaphorin 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 749 амінокислот, а молекулярна маса — 83 122.

SEMA3B
Ідентифікатори
Символи	SEMA3B, LUCA-1, SEMA5, SEMAA, SemA, semaV, semaphorin 3B
Зовнішні ІД	OMIM: 601281 MGI: 107561 HomoloGene: 20972 GeneCards: SEMA3B
Онтологія гена Молекулярна функція • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • extracellular region • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • axon guidance • cell-cell signaling • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • chemorepulsion of axon • semaphorin-plexin signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7869	20347
Ensembl	ENSG00000012171	ENSMUSG00000057969
UniProt	Q13214	Q62177
RefSeq (мРНК)	NM_001005914 NM_001290060 NM_001290061 NM_001290062 NM_001290063 NM_004636	NM_001042779 NM_001291537 NM_001291538 NM_001291539 NM_009153
RefSeq (білок)	NP_001005914 NP_001276989 NP_001276990 NP_001276991 NP_001276992 NP_004627	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 50.27 – 50.28 Mb	Хр. 9: 107.47 – 107.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRAGAAAVI		PGLALLWAVG		LGSAAPSPPR		LRLSFQELQA		WHGLQTFSLE
RTCCYQALLV		DEERGRLFVG		AENHVASLNL		DNISKRAKKL		AWPAPVEWRE
ECNWAGKDIG		TECMNFVKLL		HAYNRTHLLA		CGTGAFHPTC		AFVEVGHRAE
EPVLRLDPGR		IEDGKGKSPY		DPRHRAASVL		VGEELYSGVA		ADLMGRDFTI
FRSLGQRPSL		RTEPHDSRWL		NEPKFVKVFW		IPESENPDDD		KIYFFFRETA
VEAAPALGRL		SVSRVGQICR		NDVGGQRSLV		NKWTTFLKAR		LVCSVPGVEG
DTHFDQLQDV		FLLSSRDHRT		PLLYAVFSTS		SSIFQGSAVC		VYSMNDVRRA
FLGPFAHKEG		PMHQWVSYQG		RVPYPRPGMC		PSKTFGTFSS		TKDFPDDVIQ
FARNHPLMYN		SVLPTGGRPL		FLQVGANYTF		TQIAADRVAA		ADGHYDVLFI
GTDVGTVLKV		ISVPKGSRPS		AEGLLLEELH		VFEDSAAVTS		MQISSKRHQL
YVASRSAVAQ		IALHRCAAHG		RVCTECCLAR		DPYCAWDGVA		CTRFQPSAKR
RFRRQDVRNG		DPSTLCSGDS		SRPALLEHKV		FGVEGSSAFL		ECEPRSLQAR
VEWTFQRAGV		TAHTQVLAEE		RTERTARGLL		LRRLRRRDSG		VYLCAAVEQG
FTQPLRRLSL		HVLSATQAER		LARAEEAAPA		APPGPKLWYR		DFLQLVEPGG
GGSANSLRMC		RPQPALQSLP		LESRRKGRNR		RTHAPEPRAE		RGPRSATHW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lerman M.I., Minna J.D. (2000). The 630-kb lung cancer homozygous deletion region on human chromosome 3p21.3: identification and evaluation of the resident candidate tumor suppressor genes. Cancer Res. 60: 6116—6133. PMID 11085536

Див. також

• Хромосома 3