SEH1L

SEH1L (англ. SEH1 like nucleoporin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 39 649.

SEH1L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A9Q
Ідентифікатори
Символи	SEH1L, SEC13L, SEH1A, SEH1B, Seh1, SEH1 like nucleoporin
Зовнішні ІД	OMIM: 609263 MGI: 1919374 HomoloGene: 68701 GeneCards: SEH1L
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity • identical protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • nuclear envelope • Ядерна пора • хромосома • GATOR2 complex • nuclear pore outer ring • центромера • клітинне ядро • кінетохор • лізосома • lysosomal membrane • мембрана • Seh1-associated complex • host cell Біологічний процес • mRNA transport • attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore • chromosome segregation • cellular response to amino acid starvation • cytokine production involved in inflammatory response • поділ клітини • protein transport • клітинний цикл • mitotic metaphase plate congression • GO:0022415 viral process • nuclear pore organization • positive regulation of TOR signaling • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • mRNA export from nucleus • positive regulation of TORC1 signaling • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81929	72124
Ensembl	ENSG00000085415	ENSMUSG00000079614
UniProt	Q96EE3	Q8R2U0
RefSeq (мРНК)	NM_001013437 NM_031216	NM_001039088 NM_028112 NM_001360934
RefSeq (білок)	NP_001013455 NP_112493	NP_001034177 NP_082388 NP_001347863
Локус (UCSC)	Хр. 18: 12.95 – 12.99 Mb	Хр. 18: 67.91 – 67.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFVARSIAAD		HKDLIHDVSF		DFHGRRMATC		SSDQSVKVWD		KSESGDWHCT
ASWKTHSGSV		WRVTWAHPEF		GQVLASCSFD		RTAAVWEEIV		GESNDKLRGQ
SHWVKRTTLV		DSRTSVTDVK		FAPKHMGLML		ATCSADGIVR		IYEAPDVMNL
SQWSLQHEIS		CKLSCSCISW		NPSSSRAHSP		MIAVGSDDSS		PNAMAKVQIF
EYNENTRKYA		KAETLMTVTD		PVHDIAFAPN		LGRSFHILAI		ATKDVRIFTL
KPVRKELTSS		GGPTKFEIHI		VAQFDNHNSQ		VWRVSWNITG		TVLASSGDDG
CVRLWKANYM		DNWKCTGILK		GNGSPVNGSS		QQGTSNPSLG		STIPSLQNSL
NGSSAGRKHS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, розходження хромосом, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, хромосомах, лізосомі, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

• Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T., Matunis M.J. (2002). Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex. J. Cell Biol. 158: 915—927. PMID 12196509 DOI:10.1083/jcb.200206106
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Saxton R.A., Chantranupong L., Knockenhauer K.E., Schwartz T.U., Sabatini D.M. (2016). Mechanism of arginine sensing by CASTOR1 upstream of mTORC1. Nature. 536: 229—233. PMID 27487210 DOI:10.1038/nature19079

Див. також

• Хромосома 18