SECISBP2

SECISBP2
Ідентифікатори
Символи	SECISBP2, SBP2, SECIS binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607693 MGI: 1922670 HomoloGene: 11415 GeneCards: SECISBP2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• mRNA 3'-UTR binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • selenocysteine insertion sequence binding; • ribonucleoprotein complex binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • мітохондрія; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• Біосинтез білків; • striatum development; • neuron development; • negative regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • selenocysteine incorporation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79048
	75420
	ENSG00000187742
	ENSMUSG00000035139
	Q96T21
	н/д
NM_001282688; NM_001282689; NM_001282690; NM_024077; NM_001354696;
	NM_001354697; NM_001354698; NM_001354702
	NM_029279; NM_001308448
NP_001269617; NP_001269618; NP_001269619; NP_076982; NP_001341625;
	NP_001341626; NP_001341627; NP_001341631
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SECISBP2 (англ. SECIS binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 854 амінокислот, а молекулярна маса — 95 462^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASEGPREPE	SEGIKLSADV	KPFVPRFAGL	NVAWLESSEA	CVFPSSAATY
YPFVQEPPVT	EQKIYTEDMA	FGASTFPPQY	LSSEITLHPY	AYSPYTLDST
QNVYSVPGSQ	YLYNQPSCYR	GFQTVKHRNE	NTCPLPQEMK	ALFKKKTYDE
KKTYDQQKFD	SERADGTISS	EIKSARGSHH	LSIYAENSLK	SDGYHKRTDR
KSRIIAKNVS	TSKPEFEFTT	LDFPELQGAE	NNMSEIQKQP	KWGPVHSVST
DISLLREVVK	PAAVLSKGEI	VVKNNPNESV	TANAATNSPS	CTRELSWTPM
GYVVRQTLST	ELSAAPKNVT	SMINLKTIAS	SADPKNVSIP	SSEALSSDPS
YNKEKHIIHP	TQKSKASQGS	DLEQNEASRK	NKKKKEKSTS	KYEVLTVQEP
PRIEDAEEFP	NLAVASERRD	RIETPKFQSK	QQPQDNFKNN	VKKSQLPVQL
DLGGMLTALE	KKQHSQHAKQ	SSKPVVVSVG	AVPVLSKECA	SGERGRRMSQ
MKTPHNPLDS	SAPLMKKGKQ	REIPKAKKPT	SLKKIILKER	QERKQRLQEN
AVSPAFTSDD	TQDGESGGDD	QFPEQAELSG	PEGMDELIST	PSVEDKSEEP
PGTELQRDTE	ASHLAPNHTT	FPKIHSRRFR	DYCSQMLSKE	VDACVTDLLK
ELVRFQDRMY	QKDPVKAKTK	RRLVLGLREV	LKHLKLKKLK	CVIISPNCEK
IQSKGGLDDT	LHTIIDYACE	QNIPFVFALN	RKALGRSLNK	AVPVSVVGIF
SYDGAQDQFH	KMVELTVAAR	QAYKTMLENV	QQELVGEPRP	QAPPSLPTQG
PSCPAEDGPP	ALKEKEEPHY	IEIWKKHLEA	YSGCTLELEE	SLEASTSQMM
NLNL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білка, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

Lescure A., Allmang C., Yamada K., Carbon P., Krol A. (2002). cDNA cloning, expression pattern and RNA binding analysis of human selenocysteine insertion sequence (SECIS) binding protein 2. Gene. 291: 279—285. PMID 12095701 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00629-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30972 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96T21 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30972 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96T21 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]