SEC24B

SEC24B (англ. SEC24 homolog B, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 268 амінокислот, а молекулярна маса — 137 418.

SEC24B
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EH1
Ідентифікатори
Символи	SEC24B, SEC24, SEC24 homolog B, COPII coat complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 607184 MGI: 2139764 HomoloGene: 55968 GeneCards: SEC24B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • COPII vesicle coat • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle Біологічний процес • lung morphogenesis • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • pulmonary artery morphogenesis • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • regulation of establishment of planar polarity involved in neural tube closure • coronary artery morphogenesis • outflow tract morphogenesis • auditory receptor cell morphogenesis • aorta morphogenesis • auditory receptor cell stereocilium organization • neural tube closure • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • regulation of cargo loading into COPII-coated vesicle • lung lobe morphogenesis • cochlear nucleus development • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10427	99683
Ensembl	ENSG00000138802	ENSMUSG00000001052
UniProt	O95487	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001042734 NM_001300813 NM_006323 NM_001318085 NM_001318086	NM_207209
RefSeq (білок)	NP_001036199 NP_001287742 NP_001305014 NP_001305015 NP_006314	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 109.43 – 109.54 Mb	Хр. 3: 129.78 – 129.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAPAGSSHP		AASARIPPKF		GGAAVSGAAA		PAGPGAGPAP		HQQNGPAQNQ
MQVPSGYGLH		HQNYIAPSGH		YSQGPGKMTS		LPLDTQCGDY		YSALYTVPTQ
NVTPNTVNQQ		PGAQQLYSRG		PPAPHIVGST		LGSFQGAASS		ASHLHTSASQ
PYSSFVNHYN		SPAMYSASSS		VASQGFPSTC		GHYAMSTVSN		AAYPSVSYPS
LPAGDTYGQM		FTSQNAPTVR		PVKDNSFSGQ		NTAISHPSPL		PPLPSQQHHQ
QQSLSGYSTL		TWSSPGLPST		QDNLIRNHTG		SLAVANNNPT		ITVADSLSCP
VMQNVQPPKS		SPVVSTVLSG		SSGSSSTRTP		PTANHPVEPV		TSVTQPSELL
QQKGVQYGEY		VNNQASSAPT		PLSSTSDDEE		EEEEDEEAGV		DSSSTTSSAS
PMPNSYDALE		GGSYPDMLSS		SASSPAPDPA		PEPDPASAPA		PASAPAPVVP
QPSKMAKPFG		YGYPTLQPGY		QNATAPLISG		VQPSNPVYSG		FQQYPQQYPG
VNQLSSSIGG		LSLQSSPQPE		SLRPVNLTQE		RNILPMTPVW		APVPNLNADL
KKLNCSPDSF		RCTLTNIPQT		QALLNKAKLP		LGLLLHPFRD		LTQLPVITSN
TIVRCRSCRT		YINPFVSFID		QRRWKCNLCY		RVNDVPEEFM		YNPLTRSYGE
PHKRPEVQNS		TVEFIASSDY		MLRPPQPAVY		LFVLDVSHNA		VEAGYLTILC
QSLLENLDKL		PGDSRTRIGF		MTFDSTIHFY		NLQEGLSQPQ		MLIVSDIDDV
FLPTPDSLLV		NLYESKELIK		DLLNALPNMF		TNTRETHSAL		GPALQAAFKL
MSPTGGRVSV		FQTQLPSLGA		GLLQSREDPN		QRSSTKVVQH		LGPATDFYKK
LALDCSGQQT		AVDLFLLSSQ		YSDLASLACM		SKYSAGCIYY		YPSFHYTHNP
SQAEKLQKDL		KRYLTRKIGF		EAVMRIRCTK		GLSMHTFHGN		FFVRSTDLLS
LANINPDAGF		AVQLSIEESL		TDTSLVCFQT		ALLYTSSKGE		RRIRVHTLCL
PVVSSLADVY		AGVDVQAAIC		LLANMAVDRS		VSSSLSDARD		ALVNAVVDSL
SAYGSTVSNL		QHSALMAPSS		LKLFPLYVLA		LLKQKAFRTG		TSTRLDDRVY
AMCQIKSQPL		VHLMKMIHPN		LYRIDRLTDE		GAVHVNDRIV		PQPPLQKLSA
EKLTREGAFL		MDCGSVFYIW		VGKGCDNNFI		EDVLGYTNFA		SIPQKMTHLP
ELDTLSSERA		RSFITWLRDS		RPLSPILHIV		KDESPAKAEF		FQHLIEDRTE
AAFSYYEFLL		HVQQQICK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
• Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376
• Bonnon C., Wendeler M.W., Paccaud J.P., Hauri H.P. (2010). Selective export of human GPI-anchored proteins from the endoplasmic reticulum. J. Cell Sci. 123: 1705—1715. PMID 20427317 DOI:10.1242/jcs.062950
• Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208

Див. також

• Хромосома 4