SEC24A

SEC24A (англ. SEC24 homolog A, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 093 амінокислот, а молекулярна маса — 119 749.

SEC24A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NUP, 2NUT, 3EGD, 3EGX
Ідентифікатори
Символи	SEC24A, SEC24 homolog A, COPII coat complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 607183 MGI: 1924621 HomoloGene: 70131 GeneCards: SEC24A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • COPII vesicle coat • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • COPII vesicle coating • positive regulation of protein secretion • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading • cholesterol homeostasis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10802	77371
Ensembl	ENSG00000113615	ENSMUSG00000036391
UniProt	O95486	Q3U2P1
RefSeq (мРНК)	NM_001252231 NM_021982	NM_001290785 NM_175255
RefSeq (білок)	NP_001239160 NP_068817	NP_001277714 NP_780464
Локус (UCSC)	Хр. 5: 134.65 – 134.73 Mb	Хр. 11: 51.58 – 51.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQPGIPASG		GAPASLQAQN		GAALASGSPY		TNGPVQNALL		SSQESVSQGY
NFQLPGSYPH		PIPAKTLNPV		SGQSNYGGSQ		GSGQTLNRPP		VASNPVTPSL
HSGPAPRMPL		PASQNPATTP		MPSSSFLPEA		NLPPPLNWQY		NYPSTASQTN
HCPRASSQPT		VSGNTSLTTN		HQYVSSGYPS		LQNSFIKSGP		SVPPLVNPPL
PTTFQPGAPH		GPPPAGGPPP		VRALTPLTSS		YRDVPQPLFN		SAVNQEGITS
NTNNGSMVVH		SSYDEIEGGG		LLATPQLTNK		NPKMSRSVGY		SYPSLPPGYQ
NTTPPGATGV		PPSSLNYPSG		PQAFTQTPLG		ANHLTTSMSG		LSLQPEGLRV
VNLLQERNML		PSTPLKPPVP		NLHEDIQKLN		CNPELFRCTL		TSIPQTQALL
NKAKLPLGLL		LHPFKDLVQL		PVVTSSTIVR		CRSCRTYINP		FVSFLDQRRW
KCNLCYRVND		VPEEFLYNPL		TRVYGEPHRR		PEVQNATIEF		MAPSEYMLRP
PQPPVYLFVF		DVSHNAVETG		YLNSVCQSLL		DNLDLLPGNT		RTKIGFITFD
STIHFYGLQE		SLSQPQMLIV		SDIEDVFIPM		PENLLVNLNE		SKELVQDLLK
TLPQMFTKTL		ETQSALGPAL		QAAFKLMSPT		GGRMSVFQTQ		LPTLGVGALK
PREEPNHRSS		AKDIHMTPST		DFYKKLALDC		SGQQVAVDLF		LLSGQYSDLA
SLGCISRYSA		GSVYYYPSYH		HQHNPVQVQK		LQKELQRYLT		RKIGFEAVMR
IRCTKGLSIH		TFHGNFFVRS		TDLLSLPNVN		PDAGYAVQMS		VEESLTDTQL
VSFQSALLYT		SSKGERRIRV		HTLCLPVVST		LNDVFLGADV		QAISGLLANM
AVDRSMTASL		SDARDALVNA		VIDSLSAYRS		SVLSNQQPGL		MVPFSLRLFP
LFVLALLKQK		SFQTGTNARL		DERIFAMCQV		KNQPLVYLML		TTHPSLYRVD
NLSDEGALNI		SDRTIPQPPI		LQLSVEKLSR		DGAFLMDAGS		VLMLWVGKNC
TQNFLSQVLG		VQNYASIPQP		MTDLPELDTP		ESARIIAFIS		WLREQRPFFP
ILYVIRDESP		MKANFLQNMI		EDRTESALSY		YEFLLHIQQQ		VNK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bonnon C., Wendeler M.W., Paccaud J.P., Hauri H.P. (2010). Selective export of human GPI-anchored proteins from the endoplasmic reticulum. J. Cell Sci. 123: 1705—1715. PMID 20427317 DOI:10.1242/jcs.062950
• Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
• Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208

Див. також

• Хромосома 5