SEC22B

SEC22B (англ. SEC22 homolog B, vesicle trafficking protein (gene/pseudogene)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 215 амінокислот, а молекулярна маса — 24 593.

SEC22B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NUP, 2NUT, 3EGD, 3EGX
Ідентифікатори
Символи	SEC22B, ERS-24, SEC22L1, SEC22 homolog B, vesicle trafficking protein (gene/pseudogene), SEC22 homolog B, vesicle trafficking protein
Зовнішні ІД	OMIM: 604029 MGI: 1338759 HomoloGene: 3597 GeneCards: SEC22B
Онтологія гена Молекулярна функція • SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding • SNARE binding Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Меланосома • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • SNARE complex • Golgi membrane • transport vesicle • phagocytic vesicle membrane • ER to Golgi transport vesicle membrane • Синаптичні бульбашки Біологічний процес • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle fusion with Golgi apparatus • COPII vesicle coating • protein transport • vesicle-mediated transport • екзоцитоз • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • vesicle fusion with endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membrane • negative regulation of autophagosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9554	20333
Ensembl	ENSG00000265808	ENSMUSG00000027879
UniProt	O75396	O08547
RefSeq (мРНК)	NM_004892	NM_011342
RefSeq (білок)	NP_004883	NP_035472
Локус (UCSC)	Хр. 1: 120.15 – 120.18 Mb	Хр. 3: 97.81 – 97.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLLTMIARV		ADGLPLAASM		QEDEQSGRDL		QQYQSQAKQL		FRKLNEQSPT
RCTLEAGAMT		FHYIIEQGVC		DLVLCEAAFP		KTLAFAYLED		LHSEFDEQHG
KKVPTVSRPY		SFIEFDTFIQ		KTKKLYIDSC		ARRNLGSINT		ELQDVQRIMV
ANIEEVLQRG		EALSALDSKA		NNLSSLSKKY		RQDAKYLNMH		STYAKLAAVA
VFFIMLIVYV		RFWWL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1