SEC16A

SEC16A (англ. SEC16 homolog A, endoplasmic reticulum export factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 179 амінокислот, а молекулярна маса — 233 517.

SEC16A
Ідентифікатори
Символи	SEC16A, KIAA0310, SEC16L, p250, SEC16 homolog A, endoplasmic reticulum export factor
Зовнішні ІД	OMIM: 612854 MGI: 2139207 HomoloGene: 10533 GeneCards: SEC16A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • organelle membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • perinuclear region of cytoplasm • endoplasmic reticulum exit site Біологічний процес • protein transport • COPII vesicle coating • substantia nigra development • vesicle-mediated transport • endoplasmic reticulum organization • GO:0015915 транспорт • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • Golgi organization • protein exit from endoplasmic reticulum • response to endoplasmic reticulum stress • Golgi to plasma membrane CFTR protein transport • protein stabilization • positive regulation of protein exit from endoplasmic reticulum • protein localization to endoplasmic reticulum exit site • protein localization to plasma membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9919	227648
Ensembl	ENSG00000148396	ENSMUSG00000026924
UniProt	O15027	E9QAT4
RefSeq (мРНК)	NM_001276418 NM_014866	NM_153125
RefSeq (білок)	NP_001263347 NP_055681	NP_694765
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.44 – 136.48 Mb	Хр. 2: 26.3 – 26.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGLDRPLSR		QNPHDGVVTP		AASPSLPQPG		LQMPGQWGPV		QGGPQPSGQH
RSPCPEGPVP		SGVPCATSVP		HFPTPSILHQ		GPGHEQHSPL		VAPPAALPSD
GRDEVSHLQS		GSHLANNSDP		ESTFRQNPRI		VNHWASPELR		QNPGVKNEHR
PASALVNPLA		RGDSPENRTH		HPLGAGAGSG		CAPLEADSGA		SGALAMFFQG
GETENEENLS		SEKAGLSGQA		DFDDFCSSPG		LGRPPAPTHV		GAGSLCQALL
PGPSNEAAGD		VWGDTASTGV		PDASGSQYEN		VENLEFVQNQ		EVLPSEPLNL
DPSSPSDQFR		YGPLPGPAVP		RHGAVCHTGA		PDATLHTVHP		DSVSSSYSSR
SHGRLSGSAR		PQELVGTFIQ		QEVGKPEDEA		SGSFFKQIDS		SPVGGETDET
TVSQNYRGSV		SQPSTPSPPK		PTGIFQTSAN		SSFEPVKSHL		VGVKPFEADR
ANVVGEVRET		CVRQKQCRPA		AALPDASPGN		LEQPPDNMET		LCAPQVCPLP
LNSTTEAVHM		LPHAGAPPLD		TVYPAPEKRP		SARTQGPVKC		ESPATTLWAQ
SELPDFGGNV		LLAPAAPALY		VCAKPQPPVV		QPPEEAMSGQ		QSRNPSSAAP
VQSRGGIGAS		ENLENPPKMG		EEEALQSQAS		SGYASLLSSP		PTESLQNPPV
LIAQPDHSYN		LAQPINFSVS		LSNSHEKNQS		WREALVGDRP		AVSSWALGGD
SGENTSLSGI		PTSSVLSLSL		PSSVAQSNFP		QGSGASEMVS		NQPANLLVQP
PSQPVPENLV		PESQKDRKAG		SALPGFANSP		AGSTSVVLVP		PAHGTLVPDG
NKANHSSHQE		DTYGALDFTL		SRTLENPVNV		YNPSHSDSLA		SQQSVASHPR
QSGPGAPNLD		RFYQQVTKDA		QGQPGLERAQ		QELVPPQQQA		SPPQLPKAMF
SELSNPESLP		AQGQAQNSAQ		SPASLVLVDA		GQQLPPRPPQ		SSSVSLVSSG
SGQAAVPSEQ		PWPQPVPALA		PGPPPQDLAA		YYYYRPLYDA		YQPQYSLPYP
PEPGAASLYY		QDVYSLYEPR		YRPYDGAASA		YAQNYRYPEP		ERPSSRASHS
SERPPPRQGY		PEGYYSSKSG		WSSQSDYYAS		YYSSQYDYGD		PGHWDRYHYS
ARVRDPRTYD		RRYWCDAEYD		AYRREHSAFG		DRPEKRDNNW		RYDPRFTGSF
DDDPDPHRDP		YGEEVDRRSV		HSEHSARSLH		SAHSLASRRS		SLSSHSHQSQ
IYRSHNVAAG		SYEAPLPPGS		FHGDFAYGTY		RSNFSSGPGF		PEYGYPADTV
WPAMEQVSSR		PTSPEKFSVP		HVCARFGPGG		QLIKVIPNLP		SEGQPALVEV
HSMEALLQHT		SEQEEMRAFP		GPLAKDDTHK		VDVINFAQNK		AMKCLQNENL
IDKESASLLW		NFIVLLCRQN		GTVVGTDIAE		LLLRDHRTVW		LPGKSPNEAN
LIDFTNEAVE		QVEEEESGEA		QLSFLTGGPA		AAASSLERET		ERFRELLLYG
RKKDALESAM		KNGLWGHALL		LASKMDSRTH		ARVMTRFANS		LPINDPLQTV
YQLMSGRMPA		ASTCCGDEKW		GDWRPHLAMV		LSNLNNNMDV		ESRTMATMGD
TLASRGLLDA		AHFCYLMAQA		GFGVYTKKTT		KLVLIGSNHS		LPFLKFATNE
AIQRTEAYEY		AQSLGAETCP		LPSFQVFKFI		YSCRLAEMGL		ATQAFHYCEA
IAKSILTQPH		LYSPVLISQL		VQMASQLRLF		DPQLKEKPEE		ESLAAPTWLV
HLQQVERQIK		EGAGVWHQDG		ALPQQCPGTP		SSEMEQLDRP		GLSQPGALGI
ANPLLAVPAP		SPEHSSPSVR		LLPSAPQTLP		DGPLASPARV		PMFPVPLPPG
PLEPGPGCVT		PGPALGFLEP		SGPGLPPGVP		PLQERRHLLQ		EARSPDPGIV
PQEAPVGNSL		SELSEENFDG		KFANLTPSRT		VPDSEAPPGW		DRADSGPTQP
PLSLSPAPET		KRPGQAAKKE		TKEPKKGESW		FFRWLPGKKK		TEAYLPDDKN
KSIVWDEKKN		QWVNLNEPEE		EKKAPPPPPT		SMPKTVQAAP		PALPGPPGAP
VNMYSRRAAG		TRARYVDVLN		PSGTQRSEPA		LAPADFVAPL		APLPIPSNLF
VPTPDAEEPQ		LPDGTGREGP		AAARGLANPE		PAPEPKVLSS		AASLPGSELP
SSRPEGSQGG		ELSRCSSMSS		LSREVSQHFN		QAPGDLPAAG		GPPSGAMPFY
NPAQLAQACA		TSGSSRLGRI		GQRKHLVLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Bhattacharyya D., Glick B.S. (2007). Two mammalian Sec16 homologues have nonredundant functions in endoplasmic reticulum (ER) export and transitional ER organization. Mol. Biol. Cell. 18: 839—849. PMID 17192411 DOI:10.1091/mbc.E06-08-0707
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Watson P., Townley A.K., Koka P., Palmer K.J., Stephens D.J. (2006). Sec16 defines endoplasmic reticulum exit sites and is required for secretory cargo export in mammalian cells. Traffic. 7: 1678—1687. PMID 17005010 DOI:10.1111/j.1600-0854.2006.00493.x

Див. також

• Хромосома 9