SCAP (ген)
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SCAP (англ. SREBF chaperone) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 279 амінокислот, а молекулярна маса — 139 729[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTLTERLREK | ISRAFYNHGL | LCASYPIPII | LFTGFCILAC | CYPLLKLPLP | ||||
GTGPVEFTTP | VKDYSPPPVD | SDRKQGEPTE | QPEWYVGAPV | AYVQQIFVKS | ||||
SVFPWHKNLL | AVDVFRSPLS | RAFQLVEEIR | NHVLRDSSGI | RSLEELCLQV | ||||
TDLLPGLRKL | RNLLPEHGCL | LLSPGNFWQN | DWERFHADPD | IIGTIHQHEP | ||||
KTLQTSATLK | DLLFGVPGKY | SGVSLYTRKR | MVSYTITLVF | QHYHAKFLGS | ||||
LRARLMLLHP | SPNCSLRAES | LVHVHFKEEI | GVAELIPLVT | TYIILFAYIY | ||||
FSTRKIDMVK | SKWGLALAAV | VTVLSSLLMS | VGLCTLFGLT | PTLNGGEIFP | ||||
YLVVVIGLEN | VLVLTKSVVS | TPVDLEVKLR | IAQGLSSESW | SIMKNMATEL | ||||
GIILIGYFTL | VPAIQEFCLF | AVVGLVSDFF | LQMLFFTTVL | SIDIRRMELA | ||||
DLNKRLPPEA | CLPSAKPVGQ | PTRYERQLAV | RPSTPHTITL | QPSSFRNLRL | ||||
PKRLRVVYFL | ARTRLAQRLI | MAGTVVWIGI | LVYTDPAGLR | NYLAAQVTEQ | ||||
SPLGEGALAP | MPVPSGMLPP | SHPDPAFSIF | PPDAPKLPEN | QTSPGESPER | ||||
GGPAEVVHDS | PVPEVTWGPE | DEELWRKLSF | RHWPTLFSYY | NITLAKRYIS | ||||
LLPVIPVTLR | LNPREALEGR | HPQDGRSAWP | PPGPIPAGHW | EAGPKGPGGV | ||||
QAHGDVTLYK | VAALGLATGI | VLVLLLLCLY | RVLCPRNYGQ | LGGGPGRRRR | ||||
GELPCDDYGY | APPETEIVPL | VLRGHLMDIE | CLASDGMLLV | SCCLAGHVCV | ||||
WDAQTGDCLT | RIPRPGRQRR | DSGVGSGLEA | QESWERLSDG | GKAGPEEPGD | ||||
SPPLRHRPRG | PPPPSLFGDQ | PDLTCLIDTN | FSAQPRSSQP | TQPEPRHRAV | ||||
CGRSRDSPGY | DFSCLVQRVY | QEEGLAAVCT | PALRPPSPGP | VLSQAPEDEG | ||||
GSPEKGSPSL | AWAPSAEGSI | WSLELQGNLI | VVGRSSGRLE | VWDAIEGVLC | ||||
CSSEEVSSGI | TALVFLDKRI | VAARLNGSLD | FFSLETHTAL | SPLQFRGTPG | ||||
RGSSPASPVY | SSSDTVACHL | THTVPCAHQK | PITALKAAAG | RLVTGSQDHT | ||||
LRVFRLEDSC | CLFTLQGHSG | AITTVYIDQT | MVLASGGQDG | AICLWDVLTG | ||||
SRVSHVFAHR | GDVTSLTCTT | SCVISSGLDD | LISIWDRSTG | IKFYSIQQDL | ||||
GCGASLGVIS | DNLLVTGGQG | CVSFWDLNYG | DLLQTVYLGK | NSEAQPARQI | ||||
LVLDNAAIVC | NFGSELSLVY | VPSVLEKLD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
ред.- Nakajima T., Hamakubo T., Kodama T., Inazawa J., Emi M. (1999). Genomic structure and chromosomal mapping of the human sterol regulatory element binding protein (SREBP) cleavage-activating protein (SCAP) gene. J. Hum. Genet. 44: 402—407. PMID 10570913 DOI:10.1007/s100380050187
- Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376
- Iwaki K., Nakajima T., Ota N., Emi M. (1999). A common Ile796Val polymorphism of the human SREBP cleavage-activating protein (SCAP) gene. J. Hum. Genet. 44: 421—422. PMID 10570919 DOI:10.1007/s100380050193
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30634 (англ.) . Архів оригіналу за 15 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q12770 (англ.) . Архів оригіналу за 10 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |