SCAF4

SCAF4 (англ. SR-related CTD associated factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 147 амінокислот, а молекулярна маса — 125 869.

SCAF4
Ідентифікатори
Символи	SCAF4, SFRS15, SRA4, SR-related CTD associated factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 616023 MGI: 2146350 HomoloGene: 16227 GeneCards: SCAF4
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57466	224432
Ensembl	ENSG00000156304	ENSMUSG00000022983
UniProt	O95104	Q7TSH6
RefSeq (мРНК)	NM_001145444 NM_001145445 NM_020706	NM_178923 NM_001346799 NM_001358402
RefSeq (білок)	NP_001138916 NP_001138917 NP_065757	NP_001333728 NP_001345331 NP_849254
Локус (UCSC)	Хр. 21: 31.67 – 31.73 Mb	Хр. 16: 90.02 – 90.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAVNAFNQE		LFSLMDMKPP		ISRAKMILIT		KAAIKAIKLY		KHVVQIVEKF
IKKCKPEYKV		PGLYVIDSIV		RQSRHQFGTD		KDVFGPRFSK		NITATFQYLY
LCPSEDKSKI		VRVLNLWQKN		GVFKIEIIQP		LLDMAAGTSN		AAPVAENVTN
NEGSPPPPVK		VSSEPPTQAT		PNSVPAVPQL		PSSDAFAAVA		QLFQTTQGQQ
LQQILQTFQQ		PPKPQSPALD		NAVMAQVQAI		TAQLKTTPTQ		PSEQKAAFPP
PEQKTAFDKK		LLDRFDYDDE		PEAVEESKKE		DTTAVTTTAP		AAAVPPAPTA
TVPAAAAPAA		ASPPPPQAPF		GFPGDGMQQP		AYTQHQNMDQ		FQPRMMGIQQ
DPMHHQVPLP		PNGQMPGFGL		LPTPPFPPMA		QPVIPPTPPV		QQPFQASFQA
QNEPLTQKPH		QQEMEVEQPC		IQEVKRHMSD		NRKSRSRSAS		RSPKRRRSRS
GSRSRRSRHR		RSRSRSRDRR		RHSPRSRSQE		RRDREKERER		RQKGLPQVKP
ETASVCSTTL		WVGQLDKRTT		QQDVASLLEE		FGPIESINMI		PPRGCAYIVM
VHRQDAYRAL		QKLSRGNYKV		NQKSIKIAWA		LNKGIKADYK		QYWDVELGVT
YIPWDKVKPE		ELESFCEGGM		LDSDTLNPDW		KGIPKKPENE		VAQNGGAETS
HTEPVSPIPK		PLPVPVPPIP		VPAPITVPPP		QVPPHQPGPP		VVGALQPPAF
TPPLGIPPPG		FGPGVPPPPP		PPPFLRPGFN		PMHLPPGFLP		PGPPPPITPP
VSIPPPHTPP		ISIPNSTIAG		INEDTTKDLS		IGNPIPTVVS		GARGNAESGD
SVKMYGSAVP		PAAPTNLPTP		PVTQPVSLLG		TQGVAPGPVI		GLQAPSTGLL
GARPGLIPLQ		RPPGMPPPHL		QRFPLMPPRP		MPPHMMHRGP		PPGPGGFAMP
PPHGMKGPFP		PHGPFVRPGG		MPGLGGPGPG		PGGPEDRDGR		QQPPQQPQQQ
PQPQAPQQPQ		QQQQQQPPPS		QQPPPTQQQP		QQFRNDNRQQ		FNSGRDQERF
GRRSFGNRVE		NDRERYGNRN		DDRDNSNRDR		REWGRRSPDR		DRHRDLEERN
RRSSGHRDRE		RDSRDRESRR		EKEEARGKEK		PEVTDRAGGN		KTVEPPISQV
GNVDTASELE		KGVSEAAVLK		PSEELPAEAT		SSVEPEKDSG		SAAEAPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 21