SCAF1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SCAF1 (англ. SR-related CTD associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 312 амінокислот, а молекулярна маса — 139 270[4].
SCAF1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SCAF1, SRA1, SR-related CTD associated factor 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 617264 MGI: 2141980 HomoloGene: 10442 GeneCards: SCAF1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 49.64 – 49.66 Mb | Хр. 7: 44.65 – 44.67 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEEEDESRGK | TEESGEDRGD | GPPDRDPTLS | PSAFILRAIQ | QAVGSSLQGD | ||||
LPNDKDGSRC | HGLRWRRCRS | PRSEPRSQES | GGTDTATVLD | MATDSFLAGL | ||||
VSVLDPPDTW | VPSRLDLRPG | ESEDMLELVA | EVRIGDRDPI | PLPVPSLLPR | ||||
LRAWRTGKTV | SPQSNSSRPT | CARHLTLGTG | DGGPAPPPAP | SSASSSPSPS | ||||
PSSSSPSPPP | PPPPPAPPAP | PAPRFDIYDP | FHPTDEAYSP | PPAPEQKYDP | ||||
FEPTGSNPSS | SAGTPSPEEE | EEEEEEEEEE | EEDEEEEEGL | SQSISRISET | ||||
LAGIYDDNSL | SQDFPGDESP | RPDAQPTQPT | PAPGTPPQVD | STRADGAMRR | ||||
RVFVVGTEAE | ACREGKVSVE | VVTAGGAALP | PPLLPPGDSE | IEEGEIVQPE | ||||
EEPRLALSLF | RPGGRAARPT | PAASATPTAQ | PLPQPPAPRA | PEGDDFLSLH | ||||
AESDGEGALQ | VDLGEPAPAP | PAADSRWGGL | DLRRKILTQR | RERYRQRSPS | ||||
PAPAPAPAAA | AGPPTRKKSR | RERKRSGEAK | EAASSSSGTQ | PAPPAPASPW | ||||
DSKKHRSRDR | KPGSHASSSA | RRRSRSRSRS | RSTRRRSRST | DRRRGGSRRS | ||||
RSREKRRRRR | RSASPPPATS | SSSSSRRERH | RGKHRDGGGS | KKKKKRSRSR | ||||
GEKRSGDGSE | KAPAPAPPPS | GSTSCGDRDS | RRRGAVPPSI | QDLTDHDLFA | ||||
IKRTITVGRL | DKSDPRGPSP | APASSPKREV | LYDSEGLSGE | ERGGKSSQKD | ||||
RRRSGAASSS | SSSREKGSRR | KALDGGDRDR | DRDRDRDRDR | SSKKARPPKE | ||||
SAPSSGPPPK | PPVSSGSGSS | SSSSSCSSRK | VKLQSKVAVL | IREGVSSTTP | ||||
AKDAASAGLG | SIGVKFSRDR | ESRSPFLKPD | ERAPTEMAKA | APGSTKPKKT | ||||
KVKAKAGAKK | TKGTKGKTKP | SKTRKKVRSG | GGSGGSGGQV | SLKKSKADSC | ||||
SQAAGTKGAE | ETSWSGEERA | AKVPSTPPPK | AAPPPPALTP | DSQTVDSSCK | ||||
TPEVSFLPEE | ATEEAGVRGG | AEEEEEEEEE | EEEEEEEEEQ | QPATTTATST | ||||
AAAAPSTAPS | AGSTAGDSGA | EDGPASRVSQ | LPTLPPPMPW | NLPAGVDCTT | ||||
SGVLALTALL | FKMEEANLAS | RAKAQELIQA | TNQILSHRKP | PSSLGMTPAP | ||||
VPTSLGLPPG | PSSYLLPGSL | PLGGCGSTPP | TPTGLAATSD | KREGSSSSEG | ||||
RGDTDKYLKK | LHTQERAVEE | VKLAIKPYYQ | KKDITKEEYK | DILRKAVHKI | ||||
CHSKSGEINP | VKVSNLVRAY | VQRYRYFRKH | GRKPGDPPGP | PRPPKEPGPP | ||||
DKGGPGLPLP | PL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
ред.- Scorilas A., Kyriakopoulou L., Katsaros D., Diamandis E.P. (2001). Cloning of a gene (SR-A1), encoding for a new member of the human Ser/Arg-rich family of pre-mRNA splicing factors: overexpression in aggressive ovarian cancer. Br. J. Cancer. 85: 190—198. PMID 11461075 DOI:10.1054/bjoc.2001.1885
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Katsarou M.E., Papakyriakou A., Katsaros N., Scorilas A. (2005). Expression of the C-terminal domain of novel human SR-A1 protein: interaction with the CTD domain of RNA polymerase II. Biochem. Biophys. Res. Commun. 334: 61—68. PMID 15992770 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.06.053
- Leoutsakou T., Talieri M., Scorilas A. (2006). Expression analysis and prognostic significance of the SRA1 gene, in ovarian cancer. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 667—674. PMID 16631123 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.03.184
- Leoutsakou T., Talieri M., Scorilas A. (2006). Prognostic significance of the expression of SR-A1, encoding a novel SR-related CTD-associated factor, in breast cancer. Biol. Chem. 387: 1613—1618. PMID 17132108 DOI:10.1515/BC.2006.201
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30403 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H7N4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 березня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |