SAMSN1

SAMSN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KEA
Ідентифікатори
Символи	SAMSN1, HACS1, NASH1, SASH2, SH3D6B, SLy2, SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607978 MGI: 1914992 HomoloGene: 11148 GeneCards: SAMSN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphotyrosine residue binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ruffle; • гіалоплазма; • cell projection; • клітинне ядро; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• negative regulation of B cell activation; • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • negative regulation of adaptive immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	64092
	67742
	ENSG00000155307
	ENSMUSG00000022876
	Q9NSI8
	P57725
	NM_001256370; NM_001286523; NM_022136
	NM_023380
	NP_001243299; NP_001273452; NP_071419
	NP_075869
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SAMSN1 (англ. SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 41 708^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLKRKPSNVS	EKEKHQKPKR	SSSFGNFDRF	RNNSLSKPDD	STEAHEGDPT
NGSGEQSKTS	NNGGGLGKKM	RAISWTMKKK	VGKKYIKALS	EEKDEEDGEN
AHPYRNSDPV	IGTHTEKVSL	KASDSMDSLY	SGQSSSSGIT	SCSDGTSNRD
SFRLDDDGPY	SGPFCGRARV	HTDFTPSPYD	TDSLKIKKGD	IIDIICKTPM
GMWTGMLNNK	VGNFKFIYVD	VISEEEAAPK	KIKANRRSNS	KKSKTLQEFL
ERIHLQEYTS	TLLLNGYETL	EDLKDIKESH	LIELNIENPD	DRRRLLSAAE
NFLEEEIIQE	QENEPEPLSL	SSDISLNKSQ	LDDCPRDSGC	YISSGNSDNG
KEDLESENLS	DMVHKIIITE	PSD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10528 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NSI8 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10528 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NSI8 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 21 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]