SAMD4A

SAMD4A
Ідентифікатори
Символи	SAMD4A, SAMD4, SMAUG, SMAUG1, SMG, SMGA, sterile alpha motif domain containing 4A
Зовнішні ІД	OMIM: 610747 MGI: 1921730 HomoloGene: 19167 GeneCards: SAMD4A
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • translation repressor activity; • mRNA binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • neuron projection; • дендрит (нейробіологія); • cell projection; • синапс; • P-body; • fibrillar center; • гіалоплазма; • міжклітинні контакти;
Біологічний процес	• regulation of translation; • positive regulation of translation; • negative regulation of translation; • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • regulation of mRNA stability; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23034
	74480
	ENSG00000020577
	ENSMUSG00000021838
	Q9UPU9
	Q8CBY1
	NM_015589; NM_001161576; NM_001161577
	NM_001037221; NM_001163433; NM_028966; NM_001310544
	NP_001155048; NP_001155049; NP_056404
	NP_001032298; NP_001156905; NP_001297473; NP_083242
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SAMD4A (англ. Sterile alpha motif domain containing 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 718 амінокислот, а молекулярна маса — 79 415^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMFRDQVGVL	AGWFKGWNEC	EQTVALLSLL	KRVSQTQARF	LQLCLEHSLA
DCAELHVLER	EANSPGIINQ	WQQESKDKVI	SLLLTHLPLL	KPGNLDAKVE
YMKLLPKILA	HSIEHNQHIE	ESRQLLSYAL	IHPATSLEDR	SALAMWLNHL
EDRTSTSFGG	QNRGRSDSVD	YGQTHYYHQR	QNSDDKLNGW	QNSRDSGICI
NASNWQDKSM	GCENGHVPLY	SSSSVPTTIN	TIGTSTSTIL	SGQAHHSPLK
RSVSLTPPMN	VPNQPLGHGW	MSHEDLRARG	PQCLPSDHAP	LSPQSSVASS
GSGGSEHLED	QTTARNTFQE	EGSGMKDVPA	WLKSLRLHKY	AALFSQMTYE
EMMALTECQL	EAQNVTKGAR	HKIVISIQKL	KERQNLLKSL	ERDIIEGGSL
RIPLQELHQM	ILTPIKAYSS	PSTTPEARRR	EPQAPRQPSL	MGPESQSPDC
KDGAAATGAT	ATPSAGASGG	LQPHQLSSCD	GELAVAPLPE	GDLPGQFTRV
MGKVCTQLLV	SRPDEENISS	YLQLIDKCLI	HEAFTETQKK	RLLSWKQQVQ
KLFRSFPRKT	LLDISGYRQQ	RNRGFGQSNS	LPTAGSVGGG	MGRRNPRQYQ
IPSRNVPSAR	LGLLGTSGFV	SSNQRNTTAT	PTIMKQGRQN	LWFANPGGSN
SMPSRTHSSV	QRTRSLPVHT	SPQNMLMFQQ	PEFQLPVTEP	DINNRLESLC
LSMTEHALGD	GVDRTSTI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах, синаптосомах^[en].

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Baez M.V., Boccaccio G.L. (2005). Mammalian Smaug is a translational repressor that forms cytoplasmic foci similar to stress granules. J. Biol. Chem. 280: 43131—43140. PMID 16221671 DOI:10.1074/jbc.M508374200