RTN4

RTN4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2G31, 2JV5
Ідентифікатори
Символи	RTN4, ASY, NI220/250, NOGO, NOGO-A, NOGOC, NSP, NSP-CL, Nbla00271, Nbla10545, Nogo-B, Nogo-C, RTN-X, RTN4-A, RTN4-B1, RTN4-B2, RTN4-C, Reticulon 4
Зовнішні ІД	OMIM: 604475 MGI: 1915835 HomoloGene: 10743 GeneCards: RTN4
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • cadherin binding; • ubiquitin protein ligase binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell projection; • nuclear envelope; • мембрана; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • внутрішньоклітинний; • ендоплазматичний ретикулум; • endoplasmic reticulum membrane; • клітинна мембрана; • екзосома; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • endoplasmic reticulum tubular network; • neuronal cell body; • endoplasmic reticulum tubular network membrane; • міжклітинні контакти;
Біологічний процес	• nuclear pore complex assembly; • regulation of apoptotic process; • cerebral cortex radial glia-guided migration; • regulation of branching morphogenesis of a nerve; • cardiac epithelial to mesenchymal transition; • negative regulation of axon extension; • GO:0097285 апоптоз; • negative regulation of axonogenesis; • нейробіологія розвитку; • regulation of nervous system development; • endoplasmic reticulum tubular network formation; • endoplasmic reticulum tubular network organization; • regulation of cell migration; • negative regulation of cell growth; • axonal fasciculation; • positive regulation of epithelial cell migration; • positive regulation of mammary gland epithelial cell proliferation; • protein stabilization; • positive regulation of protein kinase B signaling; • positive regulation of protein localization to endoplasmic reticulum; • positive regulation of ERBB3 signaling pathway; • endoplasmic reticulum tubular network membrane organization; • blastocyst formation; • positive regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway; • protein localization to lysosome; • cellular sphingolipid homeostasis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	57142
	68585
	ENSG00000115310
	ENSMUSG00000020458
	Q9NQC3
	Q99P72
NM_007008; NM_020532; NM_153828; NM_207520; NM_207521;
	NM_001321859; NM_001321860; NM_001321861; NM_001321862; NM_001321863; NM_001321904
	NM_024226; NM_194051; NM_194052; NM_194053; NM_194054
NP_001308788; NP_001308789; NP_001308790; NP_001308791; NP_001308792;
	NP_001308833; NP_008939; NP_065393; NP_722550; NP_997403; NP_997404
	NP_077188; NP_918940; NP_918941; NP_918942; NP_918943
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RTN4 (англ. Reticulon 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 192 амінокислот, а молекулярна маса — 129 931^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDLDQSPLV	SSSDSPPRPQ	PAFKYQFVRE	PEDEEEEEEE	EEEDEDEDLE
ELEVLERKPA	AGLSAAPVPT	APAAGAPLMD	FGNDFVPPAP	RGPLPAAPPV
APERQPSWDP	SPVSSTVPAP	SPLSAAAVSP	SKLPEDDEPP	ARPPPPPPAS
VSPQAEPVWT	PPAPAPAAPP	STPAAPKRRG	SSGSVDETLF	ALPAASEPVI
RSSAENMDLK	EQPGNTISAG	QEDFPSVLLE	TAASLPSLSP	LSAASFKEHE
YLGNLSTVLP	TEGTLQENVS	EASKEVSEKA	KTLLIDRDLT	EFSELEYSEM
GSSFSVSPKA	ESAVIVANPR	EEIIVKNKDE	EEKLVSNNIL	HNQQELPTAL
TKLVKEDEVV	SSEKAKDSFN	EKRVAVEAPM	REEYADFKPF	ERVWEVKDSK
EDSDMLAAGG	KIESNLESKV	DKKCFADSLE	QTNHEKDSES	SNDDTSFPST
PEGIKDRSGA	YITCAPFNPA	ATESIATNIF	PLLGDPTSEN	KTDEKKIEEK
KAQIVTEKNT	STKTSNPFLV	AAQDSETDYV	TTDNLTKVTE	EVVANMPEGL
TPDLVQEACE	SELNEVTGTK	IAYETKMDLV	QTSEVMQESL	YPAAQLCPSF
EESEATPSPV	LPDIVMEAPL	NSAVPSAGAS	VIQPSSSPLE	ASSVNYESIK
HEPENPPPYE	EAMSVSLKKV	SGIKEEIKEP	ENINAALQET	EAPYISIACD
LIKETKLSAE	PAPDFSDYSE	MAKVEQPVPD	HSELVEDSSP	DSEPVDLFSD
DSIPDVPQKQ	DETVMLVKES	LTETSFESMI	EYENKEKLSA	LPPEGGKPYL
ESFKLSLDNT	KDTLLPDEVS	TLSKKEKIPL	QMEELSTAVY	SNDDLFISKE
AQIRETETFS	DSSPIEIIDE	FPTLISSKTD	SFSKLAREYT	DLEVSHKSEI
ANAPDGAGSL	PCTELPHDLS	LKNIQPKVEE	KISFSDDFSK	NGSATSKVLL
LPPDVSALAT	QAEIESIVKP	KVLVKEAEKK	LPSDTEKEDR	SPSAIFSAEL
SKTSVVDLLY	WRDIKKTGVV	FGASLFLLLS	LTVFSIVSVT	AYIALALLSV
TISFRIYKGV	IQAIQKSDEG	HPFRAYLESE	VAISEELVQK	YSNSALGHVN
CTIKELRRLF	LVDDLVDSLK	FAVLMWVFTY	VGALFNGLTL	LILALISLFS
VPVIYERHQA	QIDHYLGLAN	KNVKDAMAKI	QAKIPGLKRK	AE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як нейрогенез. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література ред.

Tagami S., Eguchi Y., Kinoshita M., Takeda M., Tsujimoto Y. (2000). A novel protein, RTN-XS, interacts with both Bcl-XL and Bcl-2 on endoplasmic reticulum and reduces their anti-apoptotic activity. Oncogene. 19: 5736—5746. PMID 11126360 DOI:10.1038/sj.onc.1203948
Oertle T., Huber C., van der Putten H., Schwab M.E. (2003). Genomic structure and functional characterisation of the promoters of human and mouse nogo/rtn4. J. Mol. Biol. 325: 299—323. PMID 12488097 DOI:10.1016/S0022-2836(02)01179-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
GrandPre T., Nakamura F., Vartanian T., Strittmatter S.M. (2000). Identification of the Nogo inhibitor of axon regeneration as a Reticulon protein. Nature. 403: 439—444. PMID 10667797 DOI:10.1038/35000226
Fournier A.E., GrandPre T., Strittmatter S.M. (2001). Identification of a receptor mediating Nogo-66 inhibition of axonal regeneration. Nature. 409: 341—346. PMID 11201742 DOI:10.1038/35053072
Ng C.E.L., Tang B.L. (2002). Nogos and the Nogo-66 receptor: factors inhibiting CNS neuron regeneration. J. Neurosci. Res. 67: 559—565. PMID 11891768 DOI:10.1002/jnr.10134