RTCA

RTCA (англ. RNA 3'-terminal phosphate cyclase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 39 337.

RTCA
Ідентифікатори
Символи	RTCA, RPC, RTC1, RTCD1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase
Зовнішні ІД	OMIM: 611286 MGI: 1913618 HomoloGene: 2766 GeneCards: RTCA
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ligase activity • каталітична активність • ATP binding • RNA binding • RNA-3'-phosphate cyclase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8634	66368
Ensembl	ENSG00000137996	ENSMUSG00000000339
UniProt	O00442	Q9D7H3
RefSeq (мРНК)	NM_001130841 NM_003729	NM_025517
RefSeq (білок)	NP_001124313 NP_003720	NP_079793
Локус (UCSC)	Хр. 1: 100.27 – 100.29 Mb	Хр. 3: 116.28 – 116.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGPRVEVDG		SIMEGGGQIL		RVSTALSCLL		GLPLRVQKIR		AGRSTPGLRP
QHLSGLEMIR		DLCDGQLEGA		EIGSTEITFT		PEKIKGGIHT		ADTKTAGSVC
LLMQVSMPCV		LFAASPSELH		LKGGTNAEMA		PQIDYTVMVF		KPIVEKFGFI
FNCDIKTRGY		YPKGGGEVIV		RMSPVKQLNP		INLTERGCVT		KIYGRAFVAG
VLPFKVAKDM		AAAAVRCIRK		EIRDLYVNIQ		PVQEPKDQAF		GNGNGIIIIA
ETSTGCLFAG		SSLGKRGVNA		DKVGIEAAEM		LLANLRHGGT		VDEYLQDQLI
VFMALANGVS		RIKTGPVTLH		TQTAIHFAEQ		IAKAKFIVKK		SEDEEDAAKD
TYIIECQGIG		MTNPNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Genschik P., Billy E., Swianiewicz M., Filipowicz W. (1997). The human RNA 3'-terminal phosphate cyclase is a member of a new family of proteins conserved in Eucarya, Bacteria and Archaea. EMBO J. 16: 2955—2967. PMID 9184239 DOI:10.1093/emboj/16.10.2955
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Filipowicz W., Vincente O. (1990). RNA 3'-terminal phosphate cyclase from HeLa cells. Methods Enzymol. 181: 499—510. PMID 2199762 DOI:10.1016/0076-6879(90)81147-M

Див. також

• Хромосома 1