RPRD2
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
RPRD2 (англ. Regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 461 амінокислот, а молекулярна маса — 156 020[4].
RPRD2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RPRD2, KIAA0460, HSPC099, regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 614695 MGI: 1922387 HomoloGene: 19997 GeneCards: RPRD2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 150.36 – 150.48 Mb | Хр. 3: 95.67 – 95.73 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAAGGGGGSS | KASSSSASSA | GALESSLDRK | FQSVTNTMES | IQGLSSWCIE | ||||
NKKHHSTIVY | HWMKWLRRSA | YPHRLNLFYL | ANDVIQNCKR | KNAIIFRESF | ||||
ADVLPEAAAL | VKDPSVSKSV | ERIFKIWEDR | NVYPEEMIVA | LREALSTTFK | ||||
TQKQLKENLN | KQPNKQWKKS | QTSTNPKAAL | KSKIVAEFRS | QALIEELLLY | ||||
KRSEDQIELK | EKQLSTMRVD | VCSTETLKCL | KDKTGGKKFS | KEFEEASSKL | ||||
EEFVNGLDKQ | VKNGPSLTEA | LENAGIFYEA | QYKEVKVVAN | AYKTFANRVN | ||||
NLKKKLDQLK | STLPDPEESP | VPSPSMDAPS | PTGSESPFQG | MGGEESQSPT | ||||
MESEKSATPE | PVTDNRDVED | MELSDVEDDG | SKIIVEDRKE | KPAEKSAVST | ||||
SVPTKPTENI | SKASSCTPVP | VTMTATPPLP | KPVNTSLSPS | PALALPNLAN | ||||
VDLAKISSIL | SSLTSVMKNT | GVSPASRPSP | GTPTSPSNLT | SGLKTPAPAT | ||||
TTSHNPLANI | LSKVEITPES | ILSALSKTQT | QSAPALQGLS | SLLQSVTGNP | ||||
VPASEAASQS | TSASPANTTV | STIKGRNLPS | SAQPFIPKSF | NYSPNSSTSE | ||||
VSSTSASKAS | IGQSPGLPST | TFKLPSNSLG | FTATHNTSPA | APPTEVTICQ | ||||
SSEVSKPKLE | SESTSPSLEM | KIHNFLKGNP | GFSGLNLNIP | ILSSLGSSAP | ||||
SESHPSDFQR | GPTSTSIDNI | DGTPVRDERS | GTPTQDEMMD | KPTSSSVDTM | ||||
SLLSKIISPG | SSTPSSTRSP | PPGRDESYPR | ELSNSVSTYR | PFGLGSESPY | ||||
KQPSDGMERP | SSLMDSSQEK | FYPDTSFQED | EDYRDFEYSG | PPPSAMMNLE | ||||
KKPAKSILKS | SKLSDTTEYQ | PILSSYSHRA | QEFGVKSAFP | PSVRALLDSS | ||||
ENCDRLSSSP | GLFGAFSVRG | NEPGSDRSPS | PSKNDSFFTP | DSNHNSLSQS | ||||
TTGHLSLPQK | QYPDSPHPVP | HRSLFSPQNT | LAAPTGHPPT | SGVEKVLAST | ||||
ISTTSTIEFK | NMLKNASRKP | SDDKHFGQAP | SKGTPSDGVS | LSNLTQPSLT | ||||
ATDQQQQEEH | YRIETRVSSS | CLDLPDSTEE | KGAPIETLGY | HSASNRRMSG | ||||
EPIQTVESIR | VPGKGNRGHG | REASRVGWFD | LSTSGSSFDN | GPSSASELAS | ||||
LGGGGSGGLT | GFKTAPYKER | APQFQESVGS | FRSNSFNSTF | EHHLPPSPLE | ||||
HGTPFQREPV | GPSSAPPVPP | KDHGGIFSRD | APTHLPSVDL | SNPFTKEAAL | ||||
AHAAPPPPPG | EHSGIPFPTP | PPPPPPGEHS | SSGGSGVPFS | TPPPPPPPVD | ||||
HSGVVPFPAP | PLAEHGVAGA | VAVFPKDHSS | LLQGTLAEHF | GVLPGPRDHG | ||||
GPTQRDLNGP | GLSRVRESLT | LPSHSLEHLG | PPHGGGGGGG | SNSSSGPPLG | ||||
PSHRDTISRS | GIILRSPRPD | FRPREPFLSR | DPFHSLKRPR | PPFARGPPFF | ||||
APKRPFFPPR | Y |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29039 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q5VT52 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |