RPL13A

RPL13A (англ. Ribosomal protein L13a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 203 амінокислот, а молекулярна маса — 23 577.

RPL13A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPL13A, L13A, TSTA1, ribosomal protein L13a
Зовнішні ІД	MGI: 1351455 HomoloGene: 111053 GeneCards: RPL13A
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA binding • RNA binding • structural constituent of ribosome Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • large ribosomal subunit • ядерце • GAIT complex • cytosolic large ribosomal subunit • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • negative regulation of translation • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • negative regulation of formation of translation preinitiation complex • cellular response to interferon-gamma • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • regulation of translation • Біосинтез білків • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23521	22121
Ensembl	ENSG00000142541	ENSMUSG00000074129
UniProt	P40429	P19253
RefSeq (мРНК)	NM_001270491 NM_012423	NM_009438
RefSeq (білок)	NP_001257420 NP_036555	NP_033464
Локус (UCSC)	Хр. 19: 49.49 – 49.49 Mb	Хр. 7: 44.77 – 44.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEVQVLVLD		GRGHLLGRLA		AIVAKQVLLG		RKVVVVRCEG		INISGNFYRN
KLKYLAFLRK		RMNTNPSRGP		YHFRAPSRIF		WRTVRGMLPH		KTKRGQAALD
RLKVFDGIPP		PYDKKKRMVV		PAALKVVRLK		PTRKFAYLGR		LAHEVGWKYQ
AVTATLEEKR		KEKAKIHYRK		KKQLMRLRKQ		AEKNVEKKID		KYTEVLKTHG
LLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Higa S., Yoshihama M., Tanaka T., Kenmochi N. (1999). Gene organization and sequence of the region containing the ribosomal protein genes RPL13A and RPS11 in the human genome and conserved features in the mouse genome. Gene. 240: 371—377. PMID 10580157 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00429-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Arif A., Chatterjee P., Moodt R.A., Fox P.L. (2012). Heterotrimeric GAIT complex drives transcript-selective translation inhibition in murine macrophages. Mol. Cell. Biol. 32: 5046—5055. PMID 23071094 DOI:10.1128/MCB.01168-12

Див. також

• Хромосома 19