RPL10A

RPL10A (англ. Ribosomal protein L10a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 24 831.

RPL10A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 3J7R
Ідентифікатори
Символи	RPL10A, CSA19, Csa-19, L10A, NEDD6, ribosomal protein L10a, uL1
Зовнішні ІД	OMIM: 615660 MGI: 1343877 HomoloGene: 68543 GeneCards: RPL10A
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • large ribosomal subunit • екзосома • клітинне ядро • cytosolic large ribosomal subunit • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • polysomal ribosome Біологічний процес • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • maturation of LSU-rRNA • Біосинтез білків • rRNA processing • response to ethanol • cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4736	19896
Ensembl	ENSG00000198755	ENSMUSG00000037805
UniProt	P62906	P53026
RefSeq (мРНК)	NM_007104	NM_011287 NM_001357628
RefSeq (білок)	NP_009035	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 35.47 – 35.47 Mb	Хр. 17: 28.55 – 28.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSKVSRDTL		YEAVREVLHG		NQRKRRKFLE		TVELQISLKN		YDPQKDKRFS
GTVRLKSTPR		PKFSVCVLGD		QQHCDEAKAV		DIPHMDIEAL		KKLNKNKKLV
KKLAKKYDAF		LASESLIKQI		PRILGPGLNK		AGKFPSLLTH		NENMVAKVDE
VKSTIKFQMK		KVLCLAVAVG		HVKMTDDELV		YNIHLAVNFL		VSLLKKNWQN
VRALYIKSTM		GKPQRLY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 6