ROS1

ROS1 (англ. ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 347 амінокислот, а молекулярна маса — 263 915.

ROS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZBF, 4UXL
Ідентифікатори
Символи	ROS1, MCF3, ROS, c-ros-1, ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 165020 MGI: 97999 HomoloGene: 2207 GeneCards: ROS1
Реагує на сполуку
entrectinib
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase activity • protein phosphatase binding • ATP binding • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • integral component of plasma membrane • receptor complex Біологічний процес • диференціація клітин • regulation of TOR signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • regulation of phosphate transport • negative regulation of gene expression • protein phosphorylation • Сперматогенез • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • проліферація • columnar/cuboidal epithelial cell development • regulation of cell growth • negative regulation of signal transduction • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6098	19886
Ensembl	ENSG00000047936	ENSMUSG00000019893
UniProt	P08922	Q78DX7
RefSeq (мРНК)	NM_002944 NM_001378891 NM_001378902	NM_011282
RefSeq (білок)	NP_002935 NP_001365820 NP_001365831	NP_035412
Локус (UCSC)	Хр. 6: 117.29 – 117.43 Mb	Хр. 10: 51.92 – 52.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKNIYCLIPK		LVNFATLGCL		WISVVQCTVL		NSCLKSCVTN		LGQQLDLGTP
HNLSEPCIQG		CHFWNSVDQK		NCALKCRESC		EVGCSSAEGA		YEEEVLENAD
LPTAPFASSI		GSHNMTLRWK		SANFSGVKYI		IQWKYAQLLG		SWTYTKTVSR
PSYVVKPLHP		FTEYIFRVVW		IFTAQLQLYS		PPSPSYRTHP		HGVPETAPLI
RNIESSSPDT		VEVSWDPPQF		PGGPILGYNL		RLISKNQKLD		AGTQRTSFQF
YSTLPNTIYR		FSIAAVNEVG		EGPEAESSIT		TSSSAVQQEE		QWLFLSRKTS
LRKRSLKHLV		DEAHCLRLDA		IYHNITGISV		DVHQQIVYFS		EGTLIWAKKA
ANMSDVSDLR		IFYRGSGLIS		SISIDWLYQR		MYFIMDELVC		VCDLENCSNI
EEITPPSISA		PQKIVADSYN		GYVFYLLRDG		IYRADLPVPS		GRCAEAVRIV
ESCTLKDFAI		KPQAKRIIYF		NDTAQVFMST		FLDGSASHLI		LPRIPFADVK
SFACENNDFL		VTDGKVIFQQ		DALSFNEFIV		GCDLSHIEEF		GFGNLVIFGS
SSQLHPLPGR		PQELSVLFGS		HQALVQWKPP		ALAIGANVIL		ISDIIELFEL
GPSAWQNWTY		EVKVSTQDPP		EVTHIFLNIS		GTMLNVPELQ		SAMKYKVSVR
ASSPKRPGPW		SEPSVGTTLV		PASEPPFIMA		VKEDGLWSKP		LNSFGPGEFL
SSDIGNVSDM		DWYNNSLYYS		DTKGDVFVWL		LNGTDISENY		HLPSIAGAGA
LAFEWLGHFL		YWAGKTYVIQ		RQSVLTGHTD		IVTHVKLLVN		DMVVDSVGGY
LYWTTLYSVE		STRLNGESSL		VLQTQPWFSG		KKVIALTLDL		SDGLLYWLVQ
DSQCIHLYTA		VLRGQSTGDT		TITEFAAWST		SEISQNALMY		YSGRLFWING
FRIITTQEIG		QKTSVSVLEP		ARFNQFTIIQ		TSLKPLPGNF		SFTPKVIPDS
VQESSFRIEG		NASSFQILWN		GPPAVDWGVV		FYSVEFSAHS		KFLASEQHSL
PVFTVEGLEP		YALFNLSVTP		YTYWGKGPKT		SLSLRAPETV		PSAPENPRIF
ILPSGKCCNK		NEVVVEFRWN		KPKHENGVLT		KFEIFYNISN		QSITNKTCED
WIAVNVTPSV		MSFQLEGMSP		RCFIAFQVRA		FTSKGPGPYA		DVVKSTTSEI
NPFPHLITLL		GNKIVFLDMD		QNQVVWTFSA		ERVISAVCYT		ADNEMGYYAE
GDSLFLLHLH		NRSSSELFQD		SLVFDITVIT		IDWISRHLYF		ALKESQNGMQ
VFDVDLEHKV		KYPREVKIHN		RNSTIISFSV		YPLLSRLYWT		EVSNFGYQMF
YYSIISHTLH		RILQPTATNQ		QNKRNQCSCN		VTEFELSGAM		AIDTSNLEKP
LIYFAKAQEI		WAMDLEGCQC		WRVITVPAML		AGKTLVSLTV		DGDLIYWIIT
AKDSTQIYQA		KKGNGAIVSQ		VKALRSRHIL		AYSSVMQPFP		DKAFLSLASD
TVEPTILNAT		NTSLTIRLPL		AKTNLTWYGI		TSPTPTYLVY		YAEVNDRKNS
SDLKYRILEF		QDSIALIEDL		QPFSTYMIQI		AVKNYYSDPL		EHLPPGKEIW
GKTKNGVPEA		VQLINTTVRS		DTSLIISWRE		SHKPNGPKES		VRYQLAISHL
ALIPETPLRQ		SEFPNGRLTL		LVTRLSGGNI		YVLKVLACHS		EEMWCTESHP
VTVEMFNTPE		KPYSLVPENT		SLQFNWKAPL		NVNLIRFWVE		LQKWKYNEFY
HVKTSCSQGP		AYVCNITNLQ		PYTSYNVRVV		VVYKTGENST		SLPESFKTKA
GVPNKPGIPK		LLEGSKNSIQ		WEKAEDNGCR		ITYYILEIRK		STSNNLQNQN
LRWKMTFNGS		CSSVCTWKSK		NLKGIFQFRV		VAANNLGFGE		YSGISENIIL
VGDDFWIPET		SFILTIIVGI		FLVVTIPLTF		VWHRRLKNQK		SAKEGVTVLI
NEDKELAELR		GLAAGVGLAN		ACYAIHTLPT		QEEIENLPAF		PREKLTLRLL
LGSGAFGEVY		EGTAVDILGV		GSGEIKVAVK		TLKKGSTDQE		KIEFLKEAHL
MSKFNHPNIL		KQLGVCLLNE		PQYIILELME		GGDLLTYLRK		ARMATFYGPL
LTLVDLVDLC		VDISKGCVYL		ERMHFIHRDL		AARNCLVSVK		DYTSPRIVKI
GDFGLARDIY		KNDYYRKRGE		GLLPVRWMAP		ESLMDGIFTT		QSDVWSFGIL
IWEILTLGHQ		PYPAHSNLDV		LNYVQTGGRL		EPPRNCPDDL		WNLMTQCWAQ
EPDQRPTFHR		IQDQLQLFRN		FFLNSIYKSR		DEANNSGVIN		ESFEGEDGDV
ICLNSDDIMP		VALMETKNRE		GLNYMVLATE		CGQGEEKSEG		PLGSQESESC
GLRKEEKEPH		ADKDFCQEKQ		VAYCPSGKPE		GLNYACLTHS		GYGDGSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Birchmeier C., O'Neill K., Riggs M., Wigler M. (1990). Characterization of ROS1 cDNA from a human glioblastoma cell line. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4799—4803. PMID 2352949 DOI:10.1073/pnas.87.12.4799
• Matsushime H., Wang L.-H., Shibuya M. (1986). Human c-ros-1 gene homologous to the v-ros sequence of UR2 sarcoma virus encodes for a transmembrane receptorlike molecule. Mol. Cell. Biol. 6: 3000—3004. PMID 3023956 DOI:10.1128/MCB.6.8.3000
• Birchmeier C., Birnbaum D., Waitches G., Fasano O., Wigler M. (1986). Characterization of an activated human ros gene. Mol. Cell. Biol. 6: 3109—3116. PMID 3785223 DOI:10.1128/MCB.6.9.3109
• Watkins D., Dion F., Poisson M., Delattre J.Y., Rouleau G.A. (1994). Analysis of oncogene expression in primary human gliomas: evidence for increased expression of the ros oncogene. Cancer Genet. Cytogenet. 72: 130—136. PMID 8143271 DOI:10.1016/0165-4608(94)90128-7

Див. також

• Хромосома 6