RNF6

RNF6
Ідентифікатори
Символи	RNF6, ring finger protein 6
Зовнішні ІД	OMIM: 604242 MGI: 1921382 HomoloGene: 14036 GeneCards: RNF6
Пов'язані генетичні захворювання
	цукровий діабет 2-го типу
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • androgen receptor binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • PML body; • cell projection; • ядерна мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • аксон; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein K27-linked ubiquitination; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • protein K48-linked ubiquitination; • protein K6-linked ubiquitination; • Убіквітин-залежний протеоліз; • regulation of androgen receptor signaling pathway; • negative regulation of axon extension; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6049
	74132
	ENSG00000127870
	ENSMUSG00000029634
	Q9Y252
	Q9DBU5
	NM_005977; NM_183043; NM_183044; NM_183045
	NM_001256085; NM_001256086; NM_001256087; NM_028774
	NP_005968; NP_898864; NP_898865; NP_898866
	NP_001243014; NP_001243015; NP_001243016; NP_083050
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNF6 (англ. Ring finger protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 685 амінокислот, а молекулярна маса — 78 091^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNQSRSRSDG	GSEETLPQDH	NHHENERRWQ	QERLHREEAY	YQFINELNDE
DYRLMRDHNL	LGTPGEITSE	ELQQRLDGVK	EQLASQPDLR	DGTNYRDSEV
PRESSHEDSL	LEWLNTFRRT	GNATRSGQNG	NQTWRAVSRT	NPNNGEFRFS
LEIHVNHENR	GFEIHGEDYT	DIPLSDSNRD	HTANRQQRST	SPVARRTRSQ
TSVNFNGSSS	NIPRTRLASR	GQNPAEGSFS	TLGRLRNGIG	GAAGIPRANA
SRTNFSSHTN	QSGGSELRQR	EGQRFGAAHV	WENGARSNVT	VRNTNQRLEP
IRLRSTSNSR	SRSPIQRQSG	TVYHNSQRES	RPVQQTTRRS	VRRRGRTRVF
LEQDRERERR	GTAYTPFSNS	RLVSRITVEE	GEESSRSSTA	VRRHPTITLD
LQVRRIRPGE	NRDRDSIANR	TRSRVGLAEN	TVTIESNSGG	FRRTISRLER
SGIRTYVSTI	TVPLRRISEN	ELVEPSSVAL	RSILRQIMTG	FGELSSLMEA
DSESELQRNG	QHLPDMHSEL	SNLGTDNNRS	QHREGSSQDR	QAQGDSTEMH
GENETTQPHT	RNSDSRGGRQ	LRNPNNLVET	GTLPILRLAH	FFLLNESDDD
DRIRGLTKEQ	IDNLSTRHYE	HNSIDSELGK	ICSVCISDYV	TGNKLRQLPC
MHEFHIHCID	RWLSENCTCP	ICRQPVLGSN	IANNG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504