RNF144A

RNF144A (англ. Ring finger protein 144A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 292 амінокислот, а молекулярна маса — 32 890.

RNF144A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WIM
Ідентифікатори
Символи	RNF144A, RNF144, UBCE7IP4, ring finger protein 144A, hUIP4, UIP4
Зовнішні ІД	MGI: 1344401 HomoloGene: 40982 GeneCards: RNF144A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin conjugating enzyme binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • cytoplasmic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ubiquitin ligase complex • endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • цитоплазма Біологічний процес • protein polyubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9781	108089
Ensembl	ENSG00000151692	ENSMUSG00000020642
UniProt	P50876	Q925F3
RefSeq (мРНК)	NM_014746 NM_001349181 NM_001349182 NM_001349183 NM_001349184 NM_001349185 NM_001349186	NM_001081977 NM_080563
RefSeq (білок)	NP_055561 NP_001336110 NP_001336111 NP_001336112 NP_001336113 NP_001336114 NP_001336115	NP_001075446 NP_542130
Локус (UCSC)	Хр. 2: 6.92 – 7.07 Mb	Хр. 12: 26.35 – 26.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTTTRYRPTW		DLALDPLVSC		KLCLGEYPVE		QMTTIAQCQC		IFCTLCLKQY
VELLIKEGLE		TAISCPDAAC		PKQGHLQENE		IECMVAAEIM		QRYKKLQFER
EVLFDPCRTW		CPASTCQAVC		QLQDVGLQTP		QPVQCKACRM		EFCSTCKASW
HPGQGCPETM		PITFLPGETS		AAFKMEEDDA		PIKRCPKCKV		YIERDEGCAQ
MMCKNCKHAF		CWYCLESLDD		DFLLIHYDKG		PCRNKLGHSR		ASVIWHRTQV
VGIFAGFGLL		LLVASPFLLL		ATPFVLCCKC		KCSKGDDDPL		PT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martinez-Noel G., Niedenthal R., Tamura T., Harbers K. (1999). A family of structurally related RING finger proteins interacts specifically with the ubiquitin-conjugating enzyme UbcM4. FEBS Lett. 454: 257—261. PMID 10431818 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00823-6
• Ho S.R., Mahanic C.S., Lee Y.J., Lin W.C. (2014). RNF144A, an E3 ubiquitin ligase for DNA-PKcs, promotes apoptosis during DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: E2646—E2655. PMID 24979766 DOI:10.1073/pnas.1323107111

Див. також

• Хромосома 2