RNF103-CHMP3

RNF103-CHMP3 (англ. Charged multivesicular body protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 222 амінокислот, а молекулярна маса — 25 073.

RNF103-CHMP3
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XZE, 3FRT, 3FRV, 2GD5
Ідентифікатори
Символи	RNF103-CHMP3, RNF103-VPS24, RNF103-CHMP3 readthrough, NEDF, hVps24, VPS24, CGI149, CHMP3
Зовнішні ІД	HomoloGene: 130401 GeneCards: RNF103-CHMP3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylcholine binding • protein homodimerization activity • ubiquitin-specific protease binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • ендосома • late endosome membrane • екзосома • ESCRT III complex • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • late endosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • multivesicular body Біологічний процес • GO:0000046 autophagosome maturation • GO:0019067 viral life cycle • protein polymerization • multivesicular body assembly • клітинний цикл • поділ клітини • regulation of mitotic spindle assembly • endosomal transport • regulation of centrosome duplication • GO:0097285 апоптоз • protein heterooligomerization • vacuolar transport • septum digestion after cytokinesis • protein transport • nucleus organization • mitotic metaphase plate congression • multivesicular body sorting pathway • regulation of exosomal secretion • macroautophagy • multivesicular body-lysosome fusion • regulation of early endosome to late endosome transport • GO:0015915 транспорт • viral budding via host ESCRT complex • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • late endosome to vacuole transport • midbody abscission Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100526767	н/д
Ensembl	ENSG00000249884	н/д
UniProt	Q9Y3E7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001198954	н/д
RefSeq (білок)	NP_001005753 NP_001180446 NP_057163	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 86.51 – 86.72 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLFGKTQEK		PPKELVNEWS		LKIRKEMRVV		DRQIRDIQRE		EEKVKRSVKD
AAKKGQKDVC		IVLAKEMIRS		RKAVSKLYAS		KAHMNSVLMG		MKNQLAVLRV
AGSLQKSTEV		MKAMQSLVKI		PEIQATMREL		SKEMMKAGII		EEMLEDTFES
MDDQEEMEEE		AEMEIDRILF		EITAGALGKA		PSKVTDALPE		PEPPGAMAAS
EDEEEEEEAL		EAMQSRLATL		RS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• Wilson E.M., Oh Y., Hwa V., Rosenfeld R.G. (2001). Interaction of IGF-binding protein-related protein 1 with a novel protein, neuroendocrine differentiation factor, results in neuroendocrine differentiation of prostate cancer cells. J. Clin. Endocrinol. Metab. 86: 4504—4511. PMID 11549700 DOI:10.1210/jcem.86.9.7845
• Khoury C.M., Yang Z., Ismail S., Greenwood M.T. (2007). Characterization of a novel alternatively spliced human transcript encoding an N-terminally truncated Vps24 protein that suppresses the effects of Bax in an ESCRT independent manner in yeast. Gene. 391: 233—241. PMID 17331679 DOI:10.1016/j.gene.2006.12.039
• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
• Lin Y., Kimpler L.A., Naismith T.V., Lauer J.M., Hanson P.I. (2005). Interaction of the mammalian endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) III protein hSnf7-1 with itself, membranes, and the AAA+ ATPase SKD1. J. Biol. Chem. 280: 12799—12809. PMID 15632132 DOI:10.1074/jbc.M413968200

Див. також

• Хромосома 2