RIOX1

RIOX1 (англ. Ribosomal oxygenase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 641 амінокислот, а молекулярна маса — 71 086.

RIOX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4CCJ, 4CCK, 4CCM, 4CCN, 4CCO, 4DIQ, 4E4H, 4Y4R, 4Y33, 4Y3O
Ідентифікатори
Символи	RIOX1, MAPJD, NO66, ROX, hsNO66, URLC2, C14orf169, chromosome 14 open reading frame 169, ribosomal oxygenase 1, JMJD9
Зовнішні ІД	OMIM: 611919 MGI: 1919202 HomoloGene: 11366 GeneCards: RIOX1
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • histone H3-methyl-lysine-4 demethylase activity • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • iron ion binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерце Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone H3-K4 demethylation • histone H3-K36 demethylation • ремоделювання хроматину • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of osteoblast differentiation • peptidyl-arginine hydroxylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79697	71952
Ensembl	ENSG00000170468	ENSMUSG00000046791
UniProt	Q9H6W3	Q9JJF3
RefSeq (мРНК)	NM_024644	NM_023633
RefSeq (білок)	NP_078920	NP_076122
Локус (UCSC)	Хр. 14: 73.49 – 73.49 Mb	Хр. 12: 84 – 84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDGLQASAGP		LRRGRPKRRR		KPQPHSGSVL		ALPLRSRKIR		KQLRSVVSRM
AALRTQTLPS		ENSEESRVES		TADDLGDALP		GGAAVAAVPD		AARREPYGHL
GPAELLEASP		AARSLQTPSA		RLVPASAPPA		RLVEVPAAPV		RVVETSALLC
TAQHLAAVQS		SGAPATASGP		QVDNTGGEPA		WDSPLRRVLA		ELNRIPSSRR
RAARLFEWLI		APMPPDHFYR		RLWEREAVLV		RRQDHTYYQG		LFSTADLDSM
LRNEEVQFGQ		HLDAARYING		RRETLNPPGR		ALPAAAWSLY		QAGCSLRLLC
PQAFSTTVWQ		FLAVLQEQFG		SMAGSNVYLT		PPNSQGFAPH		YDDIEAFVLQ
LEGRKLWRVY		RPRVPTEELA		LTSSPNFSQD		DLGEPVLQTV		LEPGDLLYFP
RGFIHQAECQ		DGVHSLHLTL		STYQRNTWGD		FLEAILPLAV		QAAMEENVEF
RRGLPRDFMD		YMGAQHSDSK		DPRRTAFMEK		VRVLVARLGH		FAPVDAVADQ
RAKDFIHDSL		PPVLTDRERA		LSVYGLPIRW		EAGEPVNVGA		QLTTETEVHM
LQDGIARLVG		EGGHLFLYYT		VENSRVYHLE		EPKCLEIYPQ		QADAMELLLG
SYPEFVRVGD		LPCDSVEDQL		SLATTLYDKG		LLLTKMPLAL		N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14