RIOK3

RIOK3 (англ. RIO kinase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 59 093.

RIOK3
Ідентифікатори
Символи	RIOK3, SUDD, RIO kinase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603579 MGI: 1914128 HomoloGene: 2843 GeneCards: RIOK3
Онтологія гена Молекулярна функція • kinase activity • transferase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • protein serine/threonine kinase activity • caspase binding Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма • preribosome, small subunit precursor Біологічний процес • protein phosphorylation • фосфорилювання • chromosome segregation • negative regulation of protein homooligomerization • positive regulation of interferon-beta production • negative regulation of MDA-5 signaling pathway • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of innate immune response • cellular response to dsRNA • cellular response to virus • cellular response to dsDNA • процес імунної системи • ribosome biogenesis • вроджений імунітет • defense response to virus • maturation of SSU-rRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8780	66878
Ensembl	ENSG00000101782	ENSMUSG00000024404
UniProt	O14730	Q9DBU3
RefSeq (мРНК)	NM_003831 NM_145906 NM_001348193	NM_024182
RefSeq (білок)	NP_003822 NP_001335122 NP_003822.2	NP_077144
Локус (UCSC)	Хр. 18: 23.45 – 23.49 Mb	Хр. 18: 12.26 – 12.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLVGVASPE		PGTAAAWGPS		KCPWAIPQNT		ISCSLADVMS		EQLAKELQLE
EEAAVFPEVA		VAEGPFITGE		NIDTSSDLML		AQMLQMEYDR		EYDAQLRREE
KKFNGDSKVS		ISFENYRKVH		PYEDSDSSED		EVDWQDTRDD		PYRPAKPVPT
PKKGFIGKGK		DITTKHDEVV		CGRKNTARME		NFAPEFQVGD		GIGMDLKLSN
HVFNALKQHA		YSEERRSARL		HEKKEHSTAE		KAVDPKTRLL		MYKMVNSGML
ETITGCISTG		KESVVFHAYG		GSMEDEKEDS		KVIPTECAIK		VFKTTLNEFK
NRDKYIKDDF		RFKDRFSKLN		PRKIIRMWAE		KEMHNLARMQ		RAGIPCPTVV
LLKKHILVMS		FIGHDQVPAP		KLKEVKLNSE		EMKEAYYQTL		HLMRQLYHEC
TLVHADLSEY		NMLWHAGKVW		LIDVSQSVEP		THPHGLEFLF		RDCRNVSQFF
QKGGVKEALS		ERELFNAVSG		LNITADNEAD		FLAEIEALEK		MNEDHVQKNG
RKAASFLKDD		GDPPLLYDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, біогенез рибосом, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Anaya P., Evans S.C., Dai C., Lozano G., May G.S. (1998). Isolation of the Aspergillus nidulans sudD gene and its human homologue. Gene. 211: 323—329. PMID 9602165 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00115-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takashima K., Oshiumi H., Takaki H., Matsumoto M., Seya T. (2015). RIOK3-mediated phosphorylation of MDA5 interferes with its assembly and attenuates the innate immune response. Cell Rep. 11: 192—200. PMID 25865883 DOI:10.1016/j.celrep.2015.03.027

Див. також

• Хромосома 18