RHBDF1

RHBDF1 (англ. Rhomboid 5 homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 97 401.

RHBDF1
Ідентифікатори
Символи	RHBDF1, C16orf8, Dist1, EGFR-RS, gene-89, gene-90, hDist1, rhomboid 5 homolog 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614403 MGI: 104328 HomoloGene: 32085 GeneCards: RHBDF1
Онтологія гена Молекулярна функція • serine-type endopeptidase activity • growth factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • protein transport • regulation of proteasomal protein catabolic process • protein processing • regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • проліферація • cell migration • negative regulation of protein secretion • протеоліз • regulation of protein secretion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64285	13650
Ensembl	ENSG00000007384	ENSMUSG00000020282
UniProt	Q96CC6	Q6PIX5
RefSeq (мРНК)	NM_022450	NM_001291818 NM_010117
RefSeq (білок)	NP_071895	NP_001278747 NP_034247
Локус (UCSC)	Хр. 16: 0.06 – 0.08 Mb	Хр. 11: 32.16 – 32.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEARRDSTS		SLQRKKPPWL		KLDIPSAVPL		TAEEPSFLQP		LRRQAFLRSV
SMPAETAHIS		SPHHELRRPV		LQRQTSITQT		IRRGTADWFG		VSKDSDSTQK
WQRKSIRHCS		QRYGKLKPQV		LRELDLPSQD		NVSLTSTETP		PPLYVGPCQL
GMQKIIDPLA		RGRAFRVADD		TAEGLSAPHT		PVTPGAASLC		SFSSSRSGFH
RLPRRRKRES		VAKMSFRAAA		ALMKGRSVRD		GTFRRAQRRS		FTPASFLEED
TTDFPDELDT		SFFAREGILH		EELSTYPDEV		FESPSEAALK		DWEKAPEQAD
LTGGALDRSE		LERSHLMLPL		ERGWRKQKEG		AAAPQPKVRL		RQEVVSTAGP
RRGQRIAVPV		RKLFAREKRP		YGLGMVGRLT		NRTYRKRIDS		FVKRQIEDMD
DHRPFFTYWL		TFVHSLVTIL		AVCIYGIAPV		GFSQHETVDS		VLRNRGVYEN
VKYVQQENFW		IGPSSEALIH		LGAKFSPCMR		QDPQVHSFIR		SAREREKHSA
CCVRNDRSGC		VQTSEEECSS		TLAVWVKWPI		HPSAPELAGH		KRQFGSVCHQ
DPRVCDEPSS		EDPHEWPEDI		TKWPICTKNS		AGNHTNHPHM		DCVITGRPCC
IGTKGRCEIT		SREYCDFMRG		YFHEEATLCS		QVHCMDDVCG		LLPFLNPEVP
DQFYRLWLSL		FLHAGILHCL		VSICFQMTVL		RDLEKLAGWH		RIAIIYLLSG
VTGNLASAIF		LPYRAEVGPA		GSQFGILACL		FVELFQSWQI		LARPWRAFFK
LLAVVLFLFT		FGLLPWIDNF		AHISGFISGL		FLSFAFLPYI		SFGKFDLYRK
RCQIIIFQVV		FLGLLAGLVV		LFYVYPVRCE		WCEFLTCIPF		TDKFCEKYEL
DAQLH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kielman M.F., Smits R., Devi T.S., Fodde R., Bernini L.F. (1993). Homology of a 130-kb region enclosing the alpha-globin gene cluster, the alpha-locus controlling region, and two non-globin genes in human and mouse. Mamm. Genome. 4: 314—323. PMID 8318735 DOI:10.1007/BF00357090
• Zettl M., Adrain C., Strisovsky K., Lastun V., Freeman M. (2011). Rhomboid family pseudoproteases use the ER quality control machinery to regulate intercellular signaling. Cell. 145: 79—91. PMID 21439629 DOI:10.1016/j.cell.2011.02.047

Див. також

• Хромосома 16