RFX5

RFX5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KW3, 3V30
Ідентифікатори
Символи	RFX5, regulatory factor X5
Зовнішні ІД	OMIM: 601863 HomoloGene: 388 GeneCards: RFX5
Пов'язані генетичні захворювання
	bare lymphocyte syndrome 2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5993
	310659
	ENSG00000143390
	ENSRNOG00000021012
	P48382
	D3ZHD7
	NM_000449; NM_001025603
	NM_001107694
NP_000440; NP_001020774; NP_001366341; NP_001366342; NP_001366343;
	NP_001366344; NP_001366345; NP_001366346; NP_001366347; NP_001366348; NP_001366349
	NP_001101164
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RFX5 (англ. Regulatory factor X5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 616 амінокислот, а молекулярна маса — 65 323^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEDEPDAKS	PKTGGRAPPG	GAEAGEPTTL	LQRLRGTISK	AVQNKVEGIL
QDVQKFSDND	KLYLYLQLPS	GPTTGDKSSE	PSTLSNEEYM	YAYRWIRNHL
EEHTDTCLPK	QSVYDAYRKY	CESLACCRPL	STANFGKIIR	EIFPDIKARR
LGGRGQSKYC	YSGIRRKTLV	SMPPLPGLDL	KGSESPEMGP	EVTPAPRDEL
VEAACALTCD	WAERILKRSF	SSIVEVARFL	LQQHLISARS	AHAHVLKAMG
LAEEDEHAPR	ERSSKPKNGL	ENPEGGAHKK	PERLAQPPKD	LEARTGAGPL
ARGERKKSVV	ESSAPGANNL	QVNALVARLP	LLLPRAPRSL	IPPIPVSPPI
LAPRLSSGAL	KVATLPLSSR	AGAPPAAVPI	INMILPTVPA	LPGPGPGPGR
APPGGLTQPR	GTENREVGIG	GDQGPHDKGV	KRTAEVPVSE	ASGQAPPAKA
AKQDIEDTAS	DAKRKRGRPR	KKSGGSGERN	STPLKSAAAM	ESAQSSRLPW
ETWGSGGEGN	SAGGAERPGP	MGEAEKGAVL	AQGQGDGTVS	KGGRGPGSQH
TKEAEDKIPL	VPSKVSVIKG	SRSQKEAFPL	AKGEVDTAPQ	GNKDLKEHVL
QSSLSQEHKD	PKATPP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Laird K.M., Briggs L.L., Boss J.M., Summers M.F., Garvie C.W. (2010). Solution structure of the heterotrimeric complex between the interaction domains of RFX5 and RFXAP from the RFX gene regulatory complex. J. Mol. Biol. 403: 40—51. PMID 20732328 DOI:10.1016/j.jmb.2010.08.025
Nekrep N., Jabrane-Ferrat N., Peterlin B.M. (2000). Mutations in the bare lymphocyte syndrome define critical steps in the assembly of the regulatory factor X complex. Mol. Cell. Biol. 20: 4455—4461. PMID 10825209 DOI:10.1128/MCB.20.12.4455-4461.2000