RFFL

RFFL (англ. Ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 363 амінокислот, а молекулярна маса — 40 514.

RFFL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Y02
Ідентифікатори
Символи	RFFL, CARP-2, CARP2, FRING, RIFIFYLIN, RNF189, RNF34L, ring finger and FYVE-like domain containing E3 ubiquitin protein ligase, ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 609735 MGI: 1914588 HomoloGene: 12116 GeneCards: RFFL
Онтологія гена Молекулярна функція • p53 binding • зв'язування з іоном металу • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • Golgi membrane • tumor necrosis factor receptor superfamily complex • recycling endosome membrane • лізосома • endosome membrane • нуклеоплазма Біологічний процес • regulation of TOR signaling • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • protein K48-linked ubiquitination • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of signal transduction by p53 class mediator • regulation of fibroblast migration • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	117584	67338
Ensembl	ENSG00000092871	ENSMUSG00000020696
UniProt	Q8WZ73	Q6ZQM0
RefSeq (мРНК)	NM_001017368 NM_057178	NM_001007465 NM_001164569 NM_001164570 NM_001164571 NM_026097
RefSeq (білок)	NP_001017368	NP_001007466 NP_001158041 NP_001158042 NP_001158043 NP_080373
Локус (UCSC)	Хр. 17: 35.01 – 35.09 Mb	Хр. 11: 82.69 – 82.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWATCCNWFC		LDGQPEEVPP		PQGARMQAYS		NPGYSSFPSP		TGLEPSCKSC
GAHFANTARK		QTCLDCKKNF		CMTCSSQVGN		GPRLCLLCQR		FRATAFQREE
LMKMKVKDLR		DYLSLHDIST		EMCREKEELV		LLVLGQQPVI		SQEDRTRAST
LSPDFPEQQA		FLTQPHSSMV		PPTSPNLPSS		SAQATSVPPA		QVQENQQANG
HVSQDQEEPV		YLESVARVPA		EDETQSIDSE		DSFVPGRRAS		LSDLTDLEDI
EGLTVRQLKE		ILARNFVNYK		GCCEKWELME		RVTRLYKDQK		GLQHLVSGAE
DQNGGAVPSG		LEENLCKICM		DSPIDCVLLE		CGHMVTCTKC		GKRMNECPIC
RQYVIRAVHV		FRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McDonald E.R. III, El-Deiry W.S. (2004). Suppression of caspase-8- and -10-associated RING proteins results in sensitization to death ligands and inhibition of tumor cell growth. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6170—6175. PMID 15069192 DOI:10.1073/pnas.0307459101
• Yang W., Dicker D.T., Chen J., El-Deiry W.S. (2008). CARPs enhance p53 turnover by degrading 14-3-3sigma and stabilizing MDM2. Cell Cycle. 7: 670—682. PMID 18382127 DOI:10.4161/cc.7.5.5701

Див. також

• Хромосома 17