RFC1

RFC1 (англ. Replication factor C subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 148 амінокислот, а молекулярна маса — 128 255.

RFC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EBU, 2K6G, 2K7F
Ідентифікатори
Символи	RFC1, RFC, replication factor C subunit 1, A1, PO-GA, RECC1, MHCBFB, RFC140, CANVAS
Зовнішні ІД	OMIM: 102579 MGI: 97891 HomoloGene: 2187 GeneCards: RFC1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0010577 enzyme activator activity • ATP binding • DNA clamp loader activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • double-stranded DNA binding • protein domain specific binding • DNA clamp unloader activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • екзосома • DNA replication factor C complex • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма • Elg1 RFC-like complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • DNA-dependent DNA replication • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • telomere maintenance via telomerase • error-free translesion synthesis • transcription, DNA-templated • error-prone translesion synthesis • реплікація ДНК • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • telomere maintenance via semi-conservative replication • DNA clamp unloading Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5981	19687
Ensembl	ENSG00000035928	ENSMUSG00000029191
UniProt	P35251	P35601
RefSeq (мРНК)	NM_001204747 NM_002913 NM_001363495 NM_001363496	NM_011258 NM_001347357 NM_001347358
RefSeq (білок)	NP_001191676 NP_002904 NP_001350424 NP_001350425	NP_001334286 NP_001334287 NP_035388
Локус (UCSC)	Хр. 4: 39.29 – 39.37 Mb	Хр. 5: 65.42 – 65.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDIRKFFGVI		PSGKKLVSET		VKKNEKTKSD		EETLKAKKGI		KEIKVNSSRK
EDDFKQKQPS		KKKRIIYDSD		SESEETLQVK		NAKKPPEKLP		VSSKPGKISR
QDPVTYISET		DEEDDFMCKK		AASKSKENGR		STNSHLGTSN		MKKNEENTKT
KNKPLSPIKL		TPTSVLDYFG		TGSVQRSNKK		MVASKRKELS		QNTDESGLND
EAIAKQLQLD		EDAELERQLH		EDEEFARTLA		MLDEEPKTKK		ARKDTEAGET
FSSVQANLSK		AEKHKYPHKV		KTAQVSDERK		SYSPRKQSKY		ESSKESQQHS
KSSADKIGEV		SSPKASSKLA		IMKRKEESSY		KEIEPVASKR		KENAIKLKGE
TKTPKKTKSS		PAKKESVSPE		DSEKKRTNYQ		AYRSYLNREG		PKALGSKEIP
KGAENCLEGL		IFVITGVLES		IERDEAKSLI		ERYGGKVTGN		VSKKTNYLVM
GRDSGQSKSD		KAAALGTKII		DEDGLLNLIR		TMPGKKSKYE		IAVETEMKKE
SKLERTPQKN		VQGKRKISPS		KKESESKKSR		PTSKRDSLAK		TIKKETDVFW
KSLDFKEQVA		EETSGDSKAR		NLADDSSENK		VENLLWVDKY		KPTSLKTIIG
QQGDQSCANK		LLRWLRNWQK		SSSEDKKHAA		KFGKFSGKDD		GSSFKAALLS
GPPGVGKTTT		ASLVCQELGY		SYVELNASDT		RSKSSLKAIV		AESLNNTSIK
GFYSNGAASS		VSTKHALIMD		EVDGMAGNED		RGGIQELIGL		IKHTKIPIIC
MCNDRNHPKI		RSLVHYCFDL		RFQRPRVEQI		KGAMMSIAFK		EGLKIPPPAM
NEIILGANQD		IRQVLHNLSM		WCARSKALTY		DQAKADSHRA		KKDIKMGPFD
VARKVFAAGE		ETAHMSLVDK		SDLFFHDYSI		APLFVQENYI		HVKPVAAGGD
MKKHLMLLSR		AADSICDGDL		VDSQIRSKQN		WSLLPAQAIY		ASVLPGELMR
GYMTQFPTFP		SWLGKHSSTG		KHDRIVQDLA		LHMSLRTYSS		KRTVNMDYLS
LLRDALVQPL		TSQGVDGVQD		VVALMDTYYL		MKEDFENIME		ISSWGGKPSP
FSKLDPKVKA		AFTRAYNKEA		HLTPYSLQAI		KASRHSTSPS		LDSEYNEELN
EDDSQSDEKD		QDAIETDAMI		KKKTKSSKPS		KPEKDKEPRK		GKGKSSKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Bunz F., Kobayashi R., Stillman B. (1993). cDNAs encoding the large subunit of human replication factor C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 11014—11018. PMID 8248204 DOI:10.1073/pnas.90.23.11014
• Lu Y., Zeft A.S., Riegel A.T. (1993). Cloning and expression of a novel human DNA binding protein, PO-GA. Biochem. Biophys. Res. Commun. 193: 779—786. PMID 8512577 DOI:10.1006/bbrc.1993.1693
• Lu Y., Riegel A.T. (1994). The human DNA-binding protein, PO-GA, is homologous to the large subunit of mouse replication factor C: regulation by alternate 3' processing of mRNA. Gene. 145: 261—265. PMID 7914507 DOI:10.1016/0378-1119(94)90017-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mossi R., Jonsson Z.O., Allen B.L., Hardin S.H., Huebscher U. (1997). Replication factor C interacts with the C-terminal side of proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 272: 1769—1776. PMID 8999859 DOI:10.1074/jbc.272.3.1769
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 4