REXO5

REXO5 (англ. RNA exonuclease 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 774 амінокислот, а молекулярна маса — 86 886.

REXO5
Ідентифікатори
Символи	REXO5, LOC81691, RNA exonuclease 5, NEF-sp
Зовнішні ІД	MGI: 1919402 HomoloGene: 12803 GeneCards: REXO5
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • ядерце • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81691	434234
Ensembl	ENSG00000005189	ENSMUSG00000030924
UniProt	Q96IC2	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001144924 NM_001199053 NM_030941	NM_001004187 NM_028129
RefSeq (білок)	NP_001138396 NP_001185982 NP_112203	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 16: 20.81 – 20.85 Mb	Хр. 7: 119.79 – 119.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPEREGTER		HPRKVRESRQ		APNKLVGAAE		AMKAGWDLEE		SQPEAKKARL
STILFTDNCE		VTHDQLCELL		KYAVLGKSNV		PKPSWCQLFH		QNHLNNVVVF
VLQGMSQLHF		YRFYLEFGCL		RKAFRHKFRL		PPPSSDFLAD		VVGLQTEQRA
GDLPKTMEGP		LPSNAKAAIN		LQDDPIIQKY		GSKKVGLTRC		LLTKEEMRTF
HFPLQGFPDC		ENFLLTKCNG		SIADNSPLFG		LDCEMCLTSK		GRELTRISLV
AEGGCCVMDE		LVKPENKILD		YLTSFSGITK		KILNPVTTKL		KDVQRQLKAL
LPPDAVLVGH		SLDLDLRALK		MIHPYVIDTS		LLYVREQGRR		FKLKFLAKVI
LGKDIQCPDR		LGHDATEDAR		TILELARYFL		KHGPKKIAEL		NLEALANHQE
IQAAGQEPKN		TAEVLQHPNT		SVLECLDSVG		QKLLFLTRET		DAGELPSSRN
CQTIKCLSNK		EVLEQARVEI		PLFPFSIVQF		SFKAFSPVLT		EEMNKRMRIK
WTEISTVYAG		PFSKNCNLRA		LKRLFKSFGP		VQSMTFVLET		RQPHLCIQYE
VLEAAQLAIE		SLDGILVDGI		CIKVQRPVTE		LTLDCDTLVN		ELEGDSENQG
SIYLSGVSET		FKEQLLQEPR		LFLGLEAVIL		PKDLKSGKQK		KYCFLKFKSF
GSAQQALNIL		TGKDWKLKGR		HALTPRHLHA		WLRGLPPEST		RLPGLRVVPP
PFEQEALQTL		KLDHPKIAAW		RWSRKIGKLY		NSLCPGTLCL		ILLPGTKSTH
GSLSGLGLMG		IKEEEESAGP		GLCS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16