REXO4

REXO4 (англ. REX4 homolog, 3'-5' exonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 422 амінокислот, а молекулярна маса — 46 672.

REXO4
Ідентифікатори
Символи	REXO4, REX4, XPMC2, XPMC2H, REX4 homolog, 3'-5' exonuclease
Зовнішні ІД	OMIM: 602930 MGI: 2684957 HomoloGene: 133948 GeneCards: REXO4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • RNA binding • single-stranded DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • endonuclease activity • 3'-5' exonuclease activity Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • nuclear speck Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • DNA catabolic process, endonucleolytic • DNA catabolic process, exonucleolytic • rRNA processing • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57109	227656
Ensembl	ENSG00000280706 ENSG00000148300	ENSMUSG00000052406
UniProt	Q9GZR2	Q6PAQ4
RefSeq (мРНК)	NM_001279349 NM_001279350 NM_001279351 NM_020385	NM_207234 NM_001362876
RefSeq (білок)	NP_001266278 NP_001266279 NP_001266280 NP_065118	NP_997117 NP_001349805
Локус (UCSC)	Хр. 9: 133.41 – 133.42 Mb	Хр. 2: 26.84 – 26.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKAKVPASK		RAPSSPVAKP		GPVKTLTRKK		NKKKKRFWKS		KAREVSKKPA
SGPGAVVRPP		KAPEDFSQNW		KALQEWLLKQ		KSQAPEKPLV		ISQMGSKKKP
KIIQQNKKET		SPQVKGEEMP		AGKDQEASRG		SVPSGSKMDR		RAPVPRTKAS
GTEHNKKGTK		ERTNGDIVPE		RGDIEHKKRK		AKEAAPAPPT		EEDIWFDDVD
PADIEAAIGP		EAAKIARKQL		GQSEGSVSLS		LVKEQAFGGL		TRALALDCEM
VGVGPKGEES		MAARVSIVNQ		YGKCVYDKYV		KPTEPVTDYR		TAVSGIRPEN
LKQGEELEVV		QKEVAEMLKG		RILVGHALHN		DLKVLFLDHP		KKKIRDTQKY
KPFKSQVKSG		RPSLRLLSEK		ILGLQVQQAE		HCSIQDAQAA		MRLYVMVKKE
WESMARDRRP		LLTAPDHCSD		DA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Kwiatkowska J., Slomski R., Jozwiak S., Short M.P., Kwiatkowski D.J. (1997). Human XPMC2H: cDNA cloning, mapping to 9q34, genomic structure, and evaluation as TSC1. Genomics. 44: 350—354. PMID 9325058 DOI:10.1006/geno.1997.4874
• Montano M.M., Wittmann B.M., Bianco N.R. (2000). Identification and characterization of a novel factor that regulates quinone reductase gene transcriptional activity. J. Biol. Chem. 275: 34306—34313. PMID 10908561 DOI:10.1074/jbc.M003880200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9