REXO2

REXO2 (англ. RNA exonuclease 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот, а молекулярна маса — 26 833.

REXO2
Ідентифікатори
Символи	REXO2, REX2, RFN, SFN, CGI-114, RNA exonuclease 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607149 MGI: 1888981 HomoloGene: 6447 GeneCards: REXO2
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • 3'-5' exonuclease activity • nucleic acid binding • 3'-5'-exoribonuclease activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондріальний міжмембранний простір • ядерце • клітинне ядро • focal adhesion • мітохондрія Біологічний процес • nucleobase-containing compound metabolic process • nucleotide metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25996	104444
Ensembl	ENSG00000076043	ENSMUSG00000032026
UniProt	Q9Y3B8	Q9D8S4
RefSeq (мРНК)	NM_015523	NM_024233 NM_001357501 NM_001357503 NM_001357505
RefSeq (білок)	NP_056338	NP_077195 NP_001344430 NP_001344432 NP_001344434
Локус (UCSC)	Хр. 11: 114.44 – 114.45 Mb	Хр. 9: 48.38 – 48.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGGSLGSRL		LRGVGGSHGR		FGARGVREGG		AAMAAGESMA		QRMVWVDLEM
TGLDIEKDQI		IEMACLITDS		DLNILAEGPN		LIIKQPDELL		DSMSDWCKEH
HGKSGLTKAV		KESTITLQQA		EYEFLSFVRQ		QTPPGLCPLA		GNSVHEDKKF
LDKYMPQFMK		HLHYRIIDVS		TVKELCRRWY		PEEYEFAPKK		AASHRALDDI
SESIKELQFY		RNNIFKKKID		EKKRKIIENG		ENEKTVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nguyen L.H., Erzberger J.P., Root J., Wilson D.M. III (2000). The human homolog of Escherichia coli Orn degrades small single-stranded RNA and DNA oligomers. J. Biol. Chem. 275: 25900—25906. PMID 10851236 DOI:10.1074/jbc.M002672200
• Mechold U., Ogryzko V., Ngo S., Danchin A. (2006). Oligoribonuclease is a common downstream target of lithium-induced pAp accumulation in Escherichia coli and human cells. Nucleic Acids Res. 34: 2364—2373. PMID 16682444 DOI:10.1093/nar/gkl247
• Bruni F., Gramegna P., Oliveira J.M., Lightowlers R.N., Chrzanowska-Lightowlers Z.M. (2013). REXO2 is an oligoribonuclease active in human mitochondria. PLoS ONE. 8: E64670—E64670. PMID 23741365 DOI:10.1371/journal.pone.0064670

Див. також

• Хромосома 11