RCAN1

RCAN1 (англ. Regulator of calcineurin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 252 амінокислот, а молекулярна маса — 28 079.

RCAN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WEY
Ідентифікатори
Символи	RCAN1, ADAPT78, CSP1, DSC1, DSCR1, MCIP1, RCN1, regulator of calcineurin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602917 MGI: 1890564 HomoloGene: 3251 GeneCards: RCAN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase regulator activity • identical protein binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • central nervous system development • calcineurin-NFAT signaling cascade • кровообіг • GO:0072468 сигнальна трансдукція • calcium-mediated signaling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of phosphoprotein phosphatase activity • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1827	54720
Ensembl	ENSG00000159200	ENSMUSG00000022951
UniProt	P53805	Q9JHG6
RefSeq (мРНК)	NM_001285389 NM_001285391 NM_001285392 NM_001285393 NM_004414 NM_203417 NM_203418 NM_001331016	NM_001081549 NM_019466
RefSeq (білок)	NP_001272318 NP_001272320 NP_001272321 NP_001272322 NP_001317945 NP_004405 NP_981962 NP_981963	NP_001075018 NP_062339
Локус (UCSC)	Хр. 21: 34.51 – 34.62 Mb	Хр. 16: 92.19 – 92.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDGVAGPQL		GAAAEAAEAA		EARARPGVTL		RPFAPLSGAA		EADEGGGDWS
FIDCEMEEVD		LQDLPSATIA		CHLDPRVFVD		GLCRAKFESL		FRTYDKDITF
QYFKSFKRVR		INFSNPFSAA		DARLQLHKTE		FLGKEMKLYF		AQTLHIGSSH
LAPPNPDKQF		LISPPASPPV		GWKQVEDATP		VINYDLLYAI		SKLGPGEKYE
LHAATDTTPS		VVVHVCESDQ		EKEEEEEMER		MRRPKPKIIQ		TRRPEYTPIH
LS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Fuentes J.-J., Pritchard M.A., Estivill X. (1997). Genomic organization, alternative splicing, and expression patterns of the DSCR1 (Down syndrome candidate region 1) gene. Genomics. 44: 358—361. PMID 9325060 DOI:10.1006/geno.1997.4866
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cho Y.J., Abe M., Kim S.Y., Sato Y. (2005). Raf-1 is a binding partner of DSCR1. Arch. Biochem. Biophys. 439: 121—128. PMID 15935327 DOI:10.1016/j.abb.2005.05.002

Див. також

• Хромосома 21