RBM19

RBM19
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DGW
Ідентифікатори
Символи	RBM19, RNA binding motif protein 19, Mrd1
Зовнішні ІД	OMIM: 616444 MGI: 1921361 HomoloGene: 7158 GeneCards: RBM19
Пов'язані генетичні захворювання
	бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ядерце; • мембрана; • нуклеоплазма; • хромосома; • клітинне ядро; • nuclear speck;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • positive regulation of embryonic development; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA cis splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9904
	74111
	ENSG00000122965
	ENSMUSG00000029594
	Q9Y4C8
	Q8R3C6
	NM_001146698; NM_001146699; NM_016196
	NM_028762
	NP_001140170; NP_001140171; NP_057280
	NP_083038
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RBM19 (англ. RNA binding motif protein 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 960 амінокислот, а молекулярна маса — 107 332^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRLIVKNLP	NGMKEERFRQ	LFAAFGTLTD	CSLKFTKDGK	FRKFGFIGFK
SEEEAQKAQK	HFNKSFIDTS	RITVEFCKSF	GDPAKPRAWS	KHAQKPSQPK
QPPKDSTTPE	IKKDEKKKKV	AGQLEKLKED	TEFQEFLSVH	QRRAQAATWA
NDGLDAEPSK	GKSKPASDYL	NFDSDSGQES	EEEGAGEDLE	EEASLEPKAA
VQKELSDMDY	LKSKMVKAGS	SSSSEEEESE	DEAVHCDEGS	EAEEEDSSAT
PVLQERDSKG	AGQEQGMPAG	KKRPPEARAE	TEKPANQKEP	TTCHTVKLRG
APFNVTEKNV	MEFLAPLKPV	AIRIVRNAHG	NKTGYIFVDF	SNEEEVKQAL
KCNREYMGGR	YIEVFREKNV	PTTKGAPKNT	TKSWQGRILG	ENEEEEDLAE
SGRLFVRNLP	YTSTEEDLEK	LFSKYGPLSE	LHYPIDSLTK	KPKGFAFITF
MFPEHAVKAY	SEVDGQVFQG	RMLHVLPSTI	KKEASEDASA	LGSSSYKKKK
EAQDKANSAS	SHNWNTLFMG	PNAVADAIAQ	KYNATKSQVF	DHETKGSVAV
RVALGETQLV	QEVRRFLIDN	GVSLDSFSQA	AAERSKTVIL	VKNLPAGTLA
AQLQETFGHF	GSLGRVLLPE	GGITAIVEFL	EPLEARKAFR	HLAYSKFHHV
PLYLEWAPVG	VFSSTAPQKK	KLQDTPSEPM	EKDPAEPETV	PDGETPEDEN
PTEEGADNSS	AKMEEEEEEE	EEEEESLPGC	TLFIKNLNFD	TTEEKLKEVF
SKVGTVKSCS	ISKKKNKAGV	LLSMGFGFVE	YRKPEQAQKA	LKQLQGHVVD
GHKLEVRISE	RATKPAVTLA	RKKQVPRKQT	TSKILVRNIP	FQAHSREIRE
LFSTFGELKT	VRLPKKMTGT	GTHRGFGFVD	FLTKQDAKRA	FNALCHSTHL
YGRRLVLEWA	DSEVTLQALR	RKTAAHFHEP	PKKKRSVVLD	EILEQLEGSD
SDSEEQTLQL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504