RBM15B

RBM15B (англ. RNA binding motif protein 15B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 890 амінокислот, а молекулярна маса — 97 205.

RBM15B
Ідентифікатори
Символи	RBM15B, HUMAGCGB, OTT3, RNA binding motif protein 15B, HsOTT3
Зовнішні ІД	OMIM: 612602 MGI: 1923598 HomoloGene: 8325 GeneCards: RBM15B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear envelope • nuclear speck • RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex Біологічний процес • mRNA processing • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • nucleocytoplasmic transport • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • RNA methylation • mRNA export from nucleus • dosage compensation by inactivation of X chromosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29890	109095
Ensembl	ENSG00000259956	ENSMUSG00000074102
UniProt	Q8NDT2	Q6PHZ5
RefSeq (мРНК)	NM_013286	NM_175402
RefSeq (білок)	NP_037418	NP_780611
Локус (UCSC)	Хр. 3: 51.39 – 51.4 Mb	Хр. 9: 106.76 – 106.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRQSERDSS		PSGRGSSSSA		KRPREREREA		EAGGRRAAHK		ASGGAKHPVP
ARARDKPRGS		GSGGGGHRDG		RGTGDANHRA		SSGRSSGSGA		GGGGRGGKAS
GDPGASGMSP		RASPLPPPPP		PPGAEPACPG		SSAAAPEYKT		LLISSLSPAL
PAEHLEDRLF		HQFKRFGEIS		LRLSHTPELG		RVAYVNFRHP		QDAREARQHA
LARQLLLYDR		PLKVEPVYLR		GGGGSSRRSS		SSSAAASTPP		PGPPAPADPL
GYLPLHGGYQ		YKQRSLSPVA		APPLREPRAR		HAAAAFALDA		AAAAAVGLSR
ERALDYYGLY		DDRGRPYGYP		AVCEEDLMPE		DDQRATRNLF		IGNLDHSVSE
VELRRAFEKY		GIIEEVVIKR		PARGQGGAYA		FLKFQNLDMA		HRAKVAMSGR
VIGRNPIKIG		YGKANPTTRL		WVGGLGPNTS		LAALAREFDR		FGSIRTIDHV
KGDSFAYIQY		ESLDAAQAAC		AKMRGFPLGG		PDRRLRVDFA		KAEETRYPQQ
YQPSPLPVHY		ELLTDGYTRH		RNLDADLVRD		RTPPHLLYSD		RDRTFLEGDW
TSPSKSSDRR		NSLEGYSRSV		RSRSGERWGA		DGDRGLPKPW		EERRKRRSLS
SDRGRTTHSP		YEERSRTKGS		GQQSERGSDR		TPERSRKENH		SSEGTKESSS
NSLSNSRHGA		EERGHHHHHH		EAADSSHGKK		ARDSERNHRT		TEAEPKPLEE
PKHETKKLKN		LSEYAQTLQL		GWNGLLVLKN		SCFPTSMHIL		EGDQGVISSL
LKDHTSGSKL		TQLKIAQRLR		LDQPKLDEVT		RRIKQGSPNG		YAVLLATQAT
PSGLGTEGMP		TVEPGLQRRL		LRNLVSYLKQ		KQAAGVISLP		VGGSKGRDGT
GMLYAFPPCD		FSQQYLQSAL		RTLGKLEEEH		MVIVIVRDTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 3