RBM14

RBM14 (англ. RNA binding motif protein 14) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 669 амінокислот, а молекулярна маса — 69 492.

RBM14
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DNP
Ідентифікатори
Символи	RBM14, COAA, PSP2, SIP, SYTIP1, TMEM137, RNA binding motif protein 14
Зовнішні ІД	OMIM: 612409 MGI: 1929092 HomoloGene: 4614 GeneCards: RBM14
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • nuclear receptor coactivator activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • mediator complex • transcription regulator complex • цитоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • glucocorticoid receptor signaling pathway • response to hormone • SMAD protein signal transduction • DNA recombination • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • реплікація ДНК • intracellular estrogen receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • negative regulation of centriole replication • histone deacetylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • centriole assembly • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10432	56275
Ensembl	ENSG00000239306	ENSMUSG00000006456
UniProt	Q96PK6	Q8C2Q3
RefSeq (мРНК)	NM_032886 NM_001198836 NM_001198837 NM_006328	NM_019869
RefSeq (білок)	NP_001185765 NP_001185766 NP_006319	NP_063922
Локус (UCSC)	Хр. 11: 66.62 – 66.63 Mb	Хр. 19: 4.85 – 4.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKIFVGNVDG		ADTTPEELAA		LFAPYGTVMS		CAVMKQFAFV		HMRENAGALR
AIEALHGHEL		RPGRALVVEM		SRPRPLNTWK		IFVGNVSAAC		TSQELRSLFE
RRGRVIECDV		VKDYAFVHME		KEADAKAAIA		QLNGKEVKGK		RINVELSTKG
QKKGPGLAVQ		SGDKTKKPGA		GDTAFPGTGG		FSATFDYQQA		FGNSTGGFDG
QARQPTPPFF		GRDRSPLRRS		PPRASYVAPL		TAQPATYRAQ		PSVSLGAAYR
AQPSASLGVG		YRTQPMTAQA		ASYRAQPSVS		LGAPYRGQLA		SPSSQSAAAS
SLGPYGGAQP		SASALSSYGG		QAAAASSLNS		YGAQGSSLAS		YGNQPSSYGA
QAASSYGVRA		AASSYNTQGA		ASSLGSYGAQ		AASYGAQSAA		SSLAYGAQAA
SYNAQPSASY		NAQSAPYAAQ		QAASYSSQPA		AYVAQPATAA		AYASQPAAYA
AQATTPMAGS		YGAQPVVQTQ		LNSYGAQASM		GLSGSYGAQS		AAAATGSYGA
AAAYGAQPSA		TLAAPYRTQS		SASLAASYAA		QQHPQAAASY		RGQPGNAYDG
AGQPSAAYLS		MSQGAVANAN		STPPPYERTR		LSPPRASYDD		PYKKAVAMSK
RYGSDRRLAE		LSDYRRLSES		QLSFRRSPTK		SSLDYRRLPD		AHSDYARYSG
SYNDYLRAAQ		MHSGYQRRM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Iwasaki T., Chin W.W., Ko L. (2001). Identification and characterization of RRM-containing coactivator activator (CoAA) as TRBP-interacting protein, and its splice variant as a coactivator modulator (CoAM). J. Biol. Chem. 276: 33375—33383. PMID 11443112 DOI:10.1074/jbc.M101517200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Iwasaki T., Koibuchi N., Chin W.W. (2005). Synovial sarcoma translocation (SYT) encodes a nuclear receptor coactivator. Endocrinology. 146: 3892—3899. PMID 15919756 DOI:10.1210/en.2004-1513
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Ahmad Y., Boisvert F.M., Lundberg E., Uhlen M., Lamond A.I. (2012). Systematic analysis of protein pools, isoforms, and modifications affecting turnover and subcellular localization. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.013680.01 — M111.013680.15. PMID 22002106 DOI:10.1074/mcp.M111.013680
• Shiratsuchi G., Takaoka K., Ashikawa T., Hamada H., Kitagawa D. (2015). RBM14 prevents assembly of centriolar protein complexes and maintains mitotic spindle integrity. EMBO J. 34: 97—114. PMID 25385835 DOI:10.15252/embj.201488979

Див. також

• Хромосома 11