RBKS

RBKS (англ. Ribokinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 34 143.

RBKS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FV7, 5C3Z, 5BYD, 5C41, 5C40, 5C3Y, 5BYF, 5BYC, 5BYE
Ідентифікатори
Символи	RBKS, Rbks, 5230400M11Rik, AI326806, RBSK, RK, ribokinase
Зовнішні ІД	OMIM: 611132 MGI: 1918586 HomoloGene: 5482 GeneCards: RBKS
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor • kinase activity • зв'язування з іоном металу • carbohydrate kinase activity • ribokinase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • D-ribose metabolic process • D-ribose catabolic process • фосфорилювання • carbohydrate phosphorylation • Пентозофосфатний шлях • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64080	71336
Ensembl	ENSG00000171174	ENSMUSG00000029136
UniProt	Q9H477	Q8R1Q9
RefSeq (мРНК)	NM_001287580 NM_022128	NM_153196
RefSeq (білок)	NP_001274509 NP_071411	NP_694876
Локус (UCSC)	Хр. 2: 27.78 – 27.89 Mb	Хр. 5: 31.78 – 31.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASGEPQRQ		WQEEVAAVVV		VGSCMTDLVS		LTSRLPKTGE		TIHGHKFFIG
FGGKGANQCV		QAARLGAMTS		MVCKVGKDSF		GNDYIENLKQ		NDISTEFTYQ
TKDAATGTAS		IIVNNEGQNI		IVIVAGANLL		LNTEDLRAAA		NVISRAKVMV
CQLEITPATS		LEALTMARRS		GVKTLFNPAP		AIADLDPQFY		TLSDVFCCNE
SEAEILTGLT		VGSAADAGEA		ALVLLKRGCQ		VVIITLGAEG		CVVLSQTEPE
PKHIPTEKVK		AVDTTGAGDS		FVGALAFYLA		YYPNLSLEDM		LNRSNFIAAV
SVQAAGTQSS		YPYKKDLPLT		LF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як вуглеводний обмін, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію, калію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Park J., van Koeverden P., Singh B., Gupta R.S. (2007). Identification and characterization of human ribokinase and comparison of its properties with E. coli ribokinase and human adenosine kinase. FEBS Lett. 581: 3211—3216. PMID 17585908 DOI:10.1016/j.febslet.2007.06.009

Див. також

• Хромосома 2