RABGAP1

RABGAP1 (англ. RAB GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 069 амінокислот, а молекулярна маса — 121 737.

RABGAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NC6
Ідентифікатори
Символи	RABGAP1, GAPCENA, TBC1D11, RAB GTPase activating protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615882 MGI: 2385139 HomoloGene: 49301 GeneCards: RABGAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • tubulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • центросома • цитоскелет • microtubule associated complex • центр організації мікротрубочок • система ендомембран Біологічний процес • regulation of cilium assembly • клітинний цикл • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23637	227800
Ensembl	ENSG00000011454	ENSMUSG00000035437
UniProt	Q9Y3P9	A2AWA9
RefSeq (мРНК)	NM_012197	NM_001033960 NM_146121 NM_001362956 NM_001362957 NM_001362958
RefSeq (білок)	NP_036329	NP_001029132 NP_666233 NP_001349885 NP_001349886 NP_001349887
Локус (UCSC)	Хр. 9: 122.94 – 123.1 Mb	Хр. 2: 37.33 – 37.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDDKASVGKI		SVSSDSVSTL		NSEDFVLVSR		QGDETPSTNN		GSDDEKTGLK
IVGNGSEQQL		QKELADVLMD		PPMDDQPGEK		ELVKRSQLDG		EGDGPLSNQL
SASSTINPVP		LVGLQKPEMS		LPVKPGQGDS		EASSPFTPVA		DEDSVVFSKL
TYLGCASVNA		PRSEVEALRM		MSILRSQCQI		SLDVTLSVPN		VSEGIVRLLD
PQTNTEIANY		PIYKILFCVR		GHDGTPESDC		FAFTESHYNA		ELFRIHVFRC
EIQEAVSRIL		YSFATAFRRS		AKQTPLSATA		APQTPDSDIF		TFSVSLEIKE
DDGKGYFSAV		PKDKDRQCFK		LRQGIDKKIV		IYVQQTTNKE		LAIERCFGLL
LSPGKDVRNS		DMHLLDLESM		GKSSDGKSYV		ITGSWNPKSP		HFQVVNEETP
KDKVLFMTTA		VDLVITEVQE		PVRFLLETKV		RVCSPNERLF		WPFSKRSTTE
NFFLKLKQIK		QRERKNNTDT		LYEVVCLESE		SERERRKTTA		SPSVRLPQSG
SQSSVIPSPP		EDDEEEDNDE		PLLSGSGDVS		KECAEKILET		WGELLSKWHL
NLNVRPKQLS		SLVRNGVPEA		LRGEVWQLLA		GCHNNDHLVE		KYRILITKES
PQDSAITRDI		NRTFPAHDYF		KDTGGDGQDS		LYKICKAYSV		YDEEIGYCQG
QSFLAAVLLL		HMPEEQAFSV		LVKIMFDYGL		RELFKQNFED		LHCKFYQLER
LMQEYIPDLY		NHFLDISLEA		HMYASQWFLT		LFTAKFPLYM		VFHIIDLLLC
EGISVIFNVA		LGLLKTSKDD		LLLTDFEGAL		KFFRVQLPKR		YRSEENAKKL
MELACNMKIS		QKKLKKYEKE		YHTMREQQAQ		QEDPIERFER		ENRRLQEANM
RLEQENDDLA		HELVTSKIAL		RKDLDNAEEK		ADALNKELLM		TKQKLIDAEE
EKRRLEEESA		QLKEMCRREL		DKAESEIKKN		SSIIGDYKQI		CSQLSERLEK
QQTANKVEIE		KIRQKVDDCE		RCREFFNKEG		RVKGISSTKE		VLDEDTDEEK
ETLKNQLREM		ELELAQTKLQ		LVEAECKIQD		LEHHLGLALN		EVQAAKKTWF
NRTLSSIKTA		TGVQGKETC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9