RABEP1

RABEP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1P4U, 1TU3, 1X79, 4N3Y, 4N3Z, 4Q9U
Ідентифікатори
Символи	RABEP1, RAB5EP, RABPT5, rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603616 MGI: 1860236 HomoloGene: 3451 GeneCards: RABEP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• growth factor activity; • protein homodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • protein domain specific binding;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • endocytic vesicle; • цитоплазма; • recycling endosome; • ендосома; • early endosome; • early endosome membrane; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• membrane fusion; • GO:0097285 апоптоз; • protein transport; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • vesicle-mediated transport; • ендоцитоз; • regulation of signaling receptor activity; • Golgi to plasma membrane transport; • protein localization to ciliary membrane; • GO:0072468 сигнальна трансдукція;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9135
	54189
	ENSG00000029725
	ENSMUSG00000020817
	Q15276
	O35551
	NM_001083585; NM_001291581; NM_001291582; NM_004703
	NM_001291141; NM_001291142; NM_001291143; NM_019400
	NP_001077054; NP_001278510; NP_001278511; NP_004694
	NP_001278070; NP_001278071; NP_001278072; NP_062273
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RABEP1 (англ. Rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 99 290^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQPGPASQP	DVSLQQRVAE	LEKINAEFLR	AQQQLEQEFN	QKRAKFKELY
LAKEEDLKRQ	NAVLQAAQDD	LGHLRTQLWE	AQAEMENIKA	IATVSENTKQ
EAIDEVKRQW	REEVASLQAV	MKETVRDYEH	QFHLRLEQER	TQWAQYRESA
EREIADLRRR	LSEGQEEENL	ENEMKKAQED	AEKLRSVVMP	MEKEIAALKD
KLTEAEDKIK	ELEASKVKEL	NHYLEAEKSC	RTDLEMYVAV	LNTQKSVLQE
DAEKLRKELH	EVCHLLEQER	QQHNQLKHTW	QKANDQFLES	QRLLMRDMQR
MEIVLTSEQL	RQVEELKKKD	QEDDEQQRLN	KRKDHKKADV	EEEIKIPVVC
ALTQEESSAQ	LSNEEEHLDS	TRGSVHSLDA	GLLLPSGDPF	SKSDNDMFKD
GLRRAQSTDS	LGTSGSLQSK	ALGYNYKAKS	AGNLDESDFG	PLVGADSVSE
NFDTASLGSL	QMPSGFMLTK	DQERAIKAMT	PEQEETASLL	SSVTQGMESA
YVSPSGYRLV	SETEWNLLQK	EVHNAGNKLG	RRCDMCSNYE	KQLQGIQIQE
AETRDQVKKL	QLMLRQANDQ	LEKTMKDKQE	LEDFIKQSSE	DSSHQISALV
LRAQASEILL	EELQQGLSQA	KRDVQEQMAV	LMQSREQVSE	ELVRLQKDND
SLQGKHSLHV	SLQQAEDFIL	PDTTEALREL	VLKYREDIIN	VRTAADHVEE
KLKAEILFLK	EQIQAEQCLK	ENLEETLQLE	IENCKEEIAS	ISSLKAELER
IKVEKGQLES	TLREKSQQLE	SLQEIKISLE	EQLKKETAAK	ATVEQLMFEE
KNKAQRLQTE	LDVSEQVQRD	FVKLSQTLQV	QLERIRQADS	LERIRAILND
TKLTDINQLP	ET

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

Stenmark H., Vitale G., Ulrich O., Zerial M. (1995). Rabaptin-5 is a direct effector of the small GTPase Rab5 in endocytic membrane fusion. Cell. 83: 423—432. PMID 8521472 DOI:10.1016/0092-8674(95)90120-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cosulich S.C., Horiuchi H., Zerial M., Clarke P.R., Woodman P.G. (1997). Cleavage of rabaptin-5 blocks endosome fusion during apoptosis. EMBO J. 16: 6182—6191. PMID 9321397 DOI:10.1093/emboj/16.20.6182
Xiao G.-H., Shoarinejad F., Jin F., Golemis E.A., Yeung R.S. (1997). The tuberous sclerosis 2 gene product, tuberin, functions as a Rab5 GTPase activating protein (GAP) in modulating endocytosis. J. Biol. Chem. 272: 6097—6100. PMID 9045618 DOI:10.1074/jbc.272.10.6097
Lippe R., Miaczynska M., Rybin V., Runge A., Zerial M. (2001). Functional synergy between Rab5 effector Rabaptin-5 and exchange factor Rabex-5 when physically associated in a complex. Mol. Biol. Cell. 12: 2219—2228. PMID 11452015 DOI:10.1091/mbc.12.7.2219
Mattera R., Arighi C.N., Lodge R., Zerial M., Bonifacino J.S. (2003). Divalent interaction of the GGAs with the Rabaptin-5-Rabex-5 complex. EMBO J. 22: 78—88. PMID 12505986 DOI:10.1093/emboj/cdg015

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17677 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15276 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17677 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15276 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]